229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2852 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  85.46 
 
 
423 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  100 
 
 
415 aa  836    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  75.32 
 
 
407 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  75.57 
 
 
406 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  74.69 
 
 
407 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  74.69 
 
 
407 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  75.06 
 
 
431 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  73.95 
 
 
407 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  74.69 
 
 
407 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  74.44 
 
 
407 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  74.44 
 
 
407 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  74 
 
 
407 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  69.85 
 
 
425 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  71.83 
 
 
407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  69.23 
 
 
416 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  69.63 
 
 
431 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  71.57 
 
 
407 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  66.67 
 
 
416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  63.77 
 
 
411 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  64.02 
 
 
411 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  64.82 
 
 
408 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  57.11 
 
 
408 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  59.62 
 
 
456 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  56.86 
 
 
408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  57.11 
 
 
410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  56.86 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  57.11 
 
 
408 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  59.28 
 
 
408 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  59.02 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  59.02 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  59.02 
 
 
408 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  61.06 
 
 
401 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  61.1 
 
 
402 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  56.02 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  57.43 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  61.17 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  60.91 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  60.05 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  59.64 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  55.69 
 
 
414 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  57.77 
 
 
412 aa  455  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  60.66 
 
 
401 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  60.41 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  57.07 
 
 
418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  55.94 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  56.85 
 
 
408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
402 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  54.59 
 
 
414 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  57.36 
 
 
408 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  58.07 
 
 
445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  60.47 
 
 
406 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  59.6 
 
 
399 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  60.47 
 
 
406 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  60.21 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  60.9 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  59.34 
 
 
407 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  58.05 
 
 
405 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  63.85 
 
 
414 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  60.55 
 
 
401 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  58.96 
 
 
403 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  61.65 
 
 
400 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  57.26 
 
 
405 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  57.5 
 
 
403 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  60.7 
 
 
404 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  60.26 
 
 
404 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  55.72 
 
 
402 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  55.59 
 
 
403 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  58.04 
 
 
400 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  60.64 
 
 
403 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  52.47 
 
 
446 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  55.31 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  54.15 
 
 
407 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  59.37 
 
 
405 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  61.15 
 
 
405 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  57.26 
 
 
405 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  58.04 
 
 
407 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  55.84 
 
 
416 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  52.02 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  54.55 
 
 
417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  53.37 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  54.55 
 
 
403 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  58.05 
 
 
406 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  54.89 
 
 
420 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  52.2 
 
 
402 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  57.5 
 
 
401 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  51.12 
 
 
407 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  58.95 
 
 
410 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  54.9 
 
 
420 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  50.5 
 
 
407 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  50.62 
 
 
420 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  58.68 
 
 
395 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  50.62 
 
 
407 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  50.37 
 
 
407 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  53.03 
 
 
415 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>