More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1595 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  100 
 
 
410 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  47.14 
 
 
424 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  49.48 
 
 
424 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  49.59 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  44.33 
 
 
423 aa  317  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  48.09 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  48.77 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  39.66 
 
 
428 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  44.56 
 
 
410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  47.33 
 
 
425 aa  308  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  44.88 
 
 
408 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  44.88 
 
 
408 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  44.54 
 
 
406 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  44.62 
 
 
423 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  44.62 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  43.41 
 
 
410 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  42.55 
 
 
413 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  45.6 
 
 
406 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  45.6 
 
 
406 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  47.28 
 
 
423 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  43.27 
 
 
407 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  47.84 
 
 
416 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  47.41 
 
 
401 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  48 
 
 
411 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  45.33 
 
 
406 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  45.3 
 
 
407 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  41.36 
 
 
403 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  43.83 
 
 
408 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  41.8 
 
 
403 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  46.78 
 
 
418 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  44.14 
 
 
431 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  46.87 
 
 
401 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  46.87 
 
 
401 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  46.6 
 
 
400 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  40.2 
 
 
418 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  46.2 
 
 
401 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  45.78 
 
 
403 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  38.14 
 
 
411 aa  293  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  46.2 
 
 
401 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  45.63 
 
 
408 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  48.78 
 
 
421 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  43.99 
 
 
411 aa  292  9e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  37.59 
 
 
413 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  44.41 
 
 
406 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  47.16 
 
 
421 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  47.74 
 
 
411 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  45.45 
 
 
505 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  43.81 
 
 
407 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  43.72 
 
 
414 aa  289  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  46.47 
 
 
402 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  43.92 
 
 
415 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  43.56 
 
 
407 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  45.19 
 
 
431 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  43.58 
 
 
414 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  43.48 
 
 
412 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  44.06 
 
 
402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  47.77 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  43.11 
 
 
417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  47.79 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  41.81 
 
 
403 aa  286  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  45.62 
 
 
402 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  45.53 
 
 
408 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  47.97 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  47.06 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  44.32 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  46.37 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  46.37 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  46.37 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  46.09 
 
 
407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  45.67 
 
 
456 aa  282  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  41.77 
 
 
429 aa  281  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  46.05 
 
 
403 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
402 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  45.53 
 
 
407 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  49.42 
 
 
408 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  42.17 
 
 
416 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  46.54 
 
 
395 aa  279  6e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  43.38 
 
 
411 aa  279  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  45.25 
 
 
407 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  43.09 
 
 
424 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  46.32 
 
 
399 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  44.92 
 
 
416 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  41.87 
 
 
423 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  41.63 
 
 
423 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  43.67 
 
 
405 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>