284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2472 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  91.63 
 
 
408 aa  722    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  100 
 
 
411 aa  822    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  96.11 
 
 
411 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  64.02 
 
 
415 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  62.62 
 
 
416 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  65.5 
 
 
423 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  67.08 
 
 
414 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  61.8 
 
 
425 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  62.63 
 
 
406 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  56.93 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  61.1 
 
 
431 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  61.93 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  62.97 
 
 
407 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  60.1 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  61.93 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  57.32 
 
 
408 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  57.53 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  59.75 
 
 
412 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  61.32 
 
 
399 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  61.81 
 
 
401 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  56.82 
 
 
408 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  61 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  61.06 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  57.07 
 
 
408 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  61.81 
 
 
401 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  56.82 
 
 
410 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  61.56 
 
 
401 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  57.82 
 
 
408 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  57.57 
 
 
408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  60.25 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  56.58 
 
 
408 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  58.33 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  57.82 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  57.82 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  56.08 
 
 
408 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  56.33 
 
 
408 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  55.53 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  61.1 
 
 
416 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  54.66 
 
 
416 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  62.96 
 
 
407 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  56.23 
 
 
414 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  62.96 
 
 
407 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  55.39 
 
 
416 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  62.6 
 
 
407 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  62.8 
 
 
407 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  62.96 
 
 
407 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  62.7 
 
 
407 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  63.23 
 
 
407 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  62.18 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  55.86 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  58.06 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  58.06 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  62.72 
 
 
407 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  57.82 
 
 
406 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  61.04 
 
 
402 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  62.6 
 
 
407 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  56.28 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  56.53 
 
 
405 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  56.42 
 
 
406 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  59.79 
 
 
400 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  54.11 
 
 
402 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  60.15 
 
 
401 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  61.15 
 
 
400 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  55.58 
 
 
446 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  57.25 
 
 
420 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  58.29 
 
 
405 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  61.06 
 
 
400 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  63.13 
 
 
410 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  62.34 
 
 
395 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  53.09 
 
 
407 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  57.72 
 
 
403 aa  428  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  60.81 
 
 
405 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  56.74 
 
 
417 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  56.53 
 
 
405 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  56.75 
 
 
402 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  58.44 
 
 
415 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  58.06 
 
 
404 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  59.11 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  57.75 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  53.12 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  58.19 
 
 
404 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  54.61 
 
 
418 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  55.85 
 
 
456 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  56.93 
 
 
403 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  54.14 
 
 
402 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  59.8 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03129  imidazolonepropionase  50.97 
 
 
419 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  55.67 
 
 
420 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  55.22 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  53.74 
 
 
403 aa  398  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  54.01 
 
 
403 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  50 
 
 
407 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  50.25 
 
 
420 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  50.25 
 
 
407 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>