More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4385 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  100 
 
 
391 aa  774    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  67.51 
 
 
389 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  64.62 
 
 
382 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  64.96 
 
 
382 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  67.09 
 
 
392 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  63.96 
 
 
393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  65.32 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  63.09 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  64.47 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  63.82 
 
 
402 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  60.87 
 
 
407 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  55.56 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  58.16 
 
 
391 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  59.17 
 
 
381 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  51.86 
 
 
400 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  53.69 
 
 
403 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  53.43 
 
 
401 aa  359  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  50.35 
 
 
454 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  42.4 
 
 
423 aa  286  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  39.01 
 
 
424 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  42.86 
 
 
424 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  42.36 
 
 
410 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  38.94 
 
 
427 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  42.25 
 
 
439 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  40.43 
 
 
414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  34.79 
 
 
411 aa  241  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  35.28 
 
 
423 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  39.21 
 
 
410 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  35.28 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  36.01 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
423 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  33.9 
 
 
411 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  34.71 
 
 
423 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  40.94 
 
 
411 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  34.91 
 
 
429 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  39.11 
 
 
424 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  38.4 
 
 
405 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  40.48 
 
 
408 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  40.48 
 
 
408 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  40.48 
 
 
408 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  33.17 
 
 
428 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
408 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4105  imidazolonepropionase  43.83 
 
 
427 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
410 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  39.09 
 
 
408 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  39.79 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  39.68 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  34.66 
 
 
413 aa  226  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  38.76 
 
 
429 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  40.63 
 
 
399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  41.85 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  40.79 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  38.12 
 
 
408 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  43.05 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  38.67 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  39.55 
 
 
400 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
414 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  38.36 
 
 
414 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  41.01 
 
 
405 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
412 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  38.66 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  41.65 
 
 
421 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  42.47 
 
 
415 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  36.56 
 
 
403 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  39.16 
 
 
401 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  38.62 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  31.45 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  31.45 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  38.7 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  39.12 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  38.61 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  38.44 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  40.72 
 
 
407 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  36.51 
 
 
403 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  38.99 
 
 
407 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  38.44 
 
 
404 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  39.08 
 
 
411 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  35.34 
 
 
407 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  42.4 
 
 
426 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  38.81 
 
 
411 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  38.56 
 
 
431 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  36.05 
 
 
405 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>