283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1313 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  85.36 
 
 
403 aa  683    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  100 
 
 
400 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  67.49 
 
 
401 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  67 
 
 
381 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  63.3 
 
 
407 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  60.37 
 
 
454 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  55.56 
 
 
469 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  54.41 
 
 
382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  57.67 
 
 
391 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  52.38 
 
 
382 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  52.99 
 
 
393 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  52.46 
 
 
389 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  54.73 
 
 
392 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  53.98 
 
 
401 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  53.48 
 
 
392 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  50.23 
 
 
416 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  53.03 
 
 
402 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  51.86 
 
 
391 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  32.35 
 
 
411 aa  222  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  35.13 
 
 
423 aa  222  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  32.39 
 
 
411 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  38.21 
 
 
424 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  34.86 
 
 
410 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
408 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  36.78 
 
 
427 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  35.91 
 
 
408 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  35.66 
 
 
408 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  36.55 
 
 
401 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  35.66 
 
 
408 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  35.66 
 
 
408 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  34.59 
 
 
414 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  35.29 
 
 
403 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  34.94 
 
 
406 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  36.06 
 
 
408 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
408 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  37.56 
 
 
399 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  35.19 
 
 
414 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  36.34 
 
 
429 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  38.63 
 
 
421 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  34.64 
 
 
414 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  35.79 
 
 
408 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  37.02 
 
 
439 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  38.63 
 
 
421 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  34.71 
 
 
408 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  36.76 
 
 
405 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  33.83 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  37.59 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  37.09 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  31.67 
 
 
412 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  30.83 
 
 
429 aa  201  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  31.67 
 
 
412 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  33.09 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  38.9 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  34.4 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  28.7 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  31.71 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  35.78 
 
 
407 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  32.84 
 
 
403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  35.73 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  32.01 
 
 
424 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
407 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  34.83 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  33.17 
 
 
418 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  35.79 
 
 
400 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  33.91 
 
 
395 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  34.16 
 
 
401 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  35.38 
 
 
427 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  34.46 
 
 
431 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  36.02 
 
 
418 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  34.58 
 
 
420 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  36.82 
 
 
401 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  38.44 
 
 
415 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  34.05 
 
 
401 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  34.95 
 
 
403 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  35.84 
 
 
406 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  34.58 
 
 
407 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  35.84 
 
 
406 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  35.81 
 
 
424 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  32.51 
 
 
407 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  34.1 
 
 
425 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  35.35 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  35.55 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  34.33 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  34.15 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  35.16 
 
 
408 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  35.26 
 
 
411 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  34.42 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  35.02 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  34.33 
 
 
407 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  34.85 
 
 
407 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>