More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1423 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  100 
 
 
391 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  62.94 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  67.01 
 
 
381 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  60.95 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  63.33 
 
 
407 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  61.2 
 
 
389 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  61.95 
 
 
392 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  61.18 
 
 
392 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  57.8 
 
 
393 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  57.67 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  59.69 
 
 
402 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  58.2 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  58.42 
 
 
403 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  56.25 
 
 
382 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  55.53 
 
 
382 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  56.44 
 
 
401 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  58.52 
 
 
391 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  51.7 
 
 
416 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  37.68 
 
 
423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
411 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  35.42 
 
 
424 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  40.48 
 
 
424 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  39.64 
 
 
403 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  38.1 
 
 
427 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  39.75 
 
 
505 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  38.56 
 
 
399 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  33.69 
 
 
411 aa  223  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  36.94 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  31.3 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  40.1 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  34.74 
 
 
423 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  39.59 
 
 
439 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  40.25 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  38.24 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  37.28 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  37.28 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  37.28 
 
 
408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  37.28 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  41.32 
 
 
414 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  41.06 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  38.6 
 
 
404 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  34.56 
 
 
423 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
410 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  32.89 
 
 
429 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  39.07 
 
 
421 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  39.07 
 
 
421 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  37.28 
 
 
408 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
407 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  37.17 
 
 
400 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
407 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  37.03 
 
 
408 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  39.33 
 
 
421 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
423 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  36.43 
 
 
424 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  36.8 
 
 
408 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  36.8 
 
 
408 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  36.8 
 
 
408 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  38.58 
 
 
407 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  33.82 
 
 
423 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  39.51 
 
 
407 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  38.1 
 
 
407 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
407 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
407 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  38.58 
 
 
407 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  33.82 
 
 
423 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  36.8 
 
 
408 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  38.32 
 
 
407 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  42.7 
 
 
415 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  36.36 
 
 
408 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  37.82 
 
 
401 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  36.23 
 
 
414 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  38.06 
 
 
407 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  37.82 
 
 
401 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  34.65 
 
 
414 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  37.57 
 
 
431 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  34.98 
 
 
429 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  33.9 
 
 
423 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  37.56 
 
 
401 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  39.48 
 
 
407 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  38.99 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  37.05 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  30.02 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  34.36 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  34.49 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  30.02 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>