More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6262 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  100 
 
 		 381 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  76.42 
 
 		 407 aa  541  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  67 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  66.5 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  66.06 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  63.44 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  64.69 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  66.75 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  62.86 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  63.09 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  66.75 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  61.58 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  61.11 
 
 		 382 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  62.69 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  62.02 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  59.69 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  59.17 
 
 		 391 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  54.94 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  44.2 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  40.98 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  36.15 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  41.47 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  41.65 
 
 		 395 aa  228  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  39.26 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  40.48 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  40.1 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  40.71 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  40.48 
 
 		 439 aa  225  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  39.59 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  39.47 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  37.9 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  34.53 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 410 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  43.41 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  41.73 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  43.12 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  40 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  39.95 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  43.51 
 
 		 426 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  39.19 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  39.29 
 
 		 408 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  40.46 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  40.57 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  36.09 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  43.96 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  37.14 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  40 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  37.36 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  34.45 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  40.8 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  38.15 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  39.69 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  43.65 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  38.35 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  39.59 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  39.9 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  33.42 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  40.43 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  38.97 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  40.62 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  38.8 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  39.65 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  41.03 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  36.46 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  40.99 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  40.16 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  31.77 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  34.99 
 
 		 423 aa  205  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  35.64 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  38.87 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  39.3 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  40.57 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  40.58 
 
 		 407 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  40.85 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  39.48 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  38.38 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  38.54 
 
 		 402 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  35.22 
 
 		 418 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  39.26 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  34.72 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  39.69 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  35.04 
 
 		 414 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  37.37 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  39.04 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  39.43 
 
 		 431 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  37.57 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  34.47 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  34.47 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>