More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  100 
 
 
393 aa  789    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  69.97 
 
 
389 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  68.3 
 
 
392 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  65.71 
 
 
469 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  67.28 
 
 
382 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  66.75 
 
 
392 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  63.66 
 
 
401 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  67.41 
 
 
382 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  62.92 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  63.96 
 
 
391 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  63.1 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  63.09 
 
 
381 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  56.1 
 
 
416 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  57.8 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  54.61 
 
 
454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  52.99 
 
 
400 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  54.61 
 
 
401 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  52.59 
 
 
403 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
423 aa  273  5.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  42.29 
 
 
424 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  43.72 
 
 
410 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
427 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  42.64 
 
 
414 aa  256  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  42.26 
 
 
408 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  43.01 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
408 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  41.99 
 
 
408 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  43.58 
 
 
424 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
408 aa  249  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  39.12 
 
 
423 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  38.63 
 
 
423 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  39.12 
 
 
423 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  42.04 
 
 
408 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  38.88 
 
 
423 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  41.03 
 
 
405 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  41.71 
 
 
408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  38.39 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  41.09 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  38.73 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  40.84 
 
 
406 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  40.89 
 
 
414 aa  243  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  42.33 
 
 
414 aa  243  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  42.86 
 
 
424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  36.24 
 
 
411 aa  239  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  39.71 
 
 
429 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  36.04 
 
 
428 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  41.15 
 
 
410 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  35.81 
 
 
411 aa  235  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  42.48 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  41.58 
 
 
406 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  41.11 
 
 
401 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  41.69 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  34.04 
 
 
412 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  34.04 
 
 
412 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  38.84 
 
 
423 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  41.81 
 
 
429 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  40.75 
 
 
411 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  40.31 
 
 
407 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  40.31 
 
 
407 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4105  imidazolonepropionase  45.53 
 
 
427 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  36.91 
 
 
413 aa  227  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  40.26 
 
 
400 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  39.85 
 
 
407 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  39.79 
 
 
407 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  39.79 
 
 
407 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
425 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  40.58 
 
 
431 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  38.4 
 
 
407 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  42.97 
 
 
414 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  43.67 
 
 
415 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  40.1 
 
 
407 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  39.28 
 
 
407 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  37.47 
 
 
403 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  40.91 
 
 
395 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  38.97 
 
 
411 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  39.16 
 
 
401 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  38.76 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  37.99 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  38.26 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  39.53 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  39.5 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  38.44 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  37.98 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  36.23 
 
 
418 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>