285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4450 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  100 
 
 
407 aa  794    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  76.42 
 
 
381 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  63.3 
 
 
400 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  63.08 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  63.1 
 
 
393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  63.33 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  64.68 
 
 
401 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  63.45 
 
 
401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  60.78 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  62.82 
 
 
391 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  61.46 
 
 
389 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  59.57 
 
 
382 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  61.7 
 
 
392 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  58.96 
 
 
382 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  60.87 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  61.18 
 
 
392 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  59.6 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  53.51 
 
 
416 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  38.94 
 
 
423 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  41.01 
 
 
424 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  43.29 
 
 
421 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  44.2 
 
 
421 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
421 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  42.16 
 
 
395 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  34.15 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  41.44 
 
 
411 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  39.57 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  34.61 
 
 
423 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  34.37 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  34.37 
 
 
423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  213  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  36.8 
 
 
427 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  31.54 
 
 
411 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  43.16 
 
 
415 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  37.2 
 
 
414 aa  211  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  37.07 
 
 
424 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  38.13 
 
 
411 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
412 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  30.92 
 
 
412 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  31.92 
 
 
413 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  42.82 
 
 
426 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  37.27 
 
 
410 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  29.93 
 
 
428 aa  202  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  37.95 
 
 
400 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  33.58 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  38.13 
 
 
401 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  38.18 
 
 
410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  36.96 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  37.82 
 
 
408 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  38.62 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  37.27 
 
 
408 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  35.42 
 
 
405 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3268  imidazolonepropionase  35.49 
 
 
404 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00728606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  37.27 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
408 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  37.43 
 
 
424 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  41.78 
 
 
414 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  37.27 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  37.08 
 
 
408 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  37.01 
 
 
408 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  37.53 
 
 
408 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2271  imidazolonepropionase (imidazolone-5-propionate hydrolase)  37.16 
 
 
402 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  35.98 
 
 
403 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  37.96 
 
 
406 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  38.01 
 
 
420 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  38.1 
 
 
399 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
408 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  31 
 
 
429 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  39.21 
 
 
410 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  36.79 
 
 
408 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  37.57 
 
 
417 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  34.16 
 
 
403 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  37.2 
 
 
401 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  35.47 
 
 
406 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  38.14 
 
 
427 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
401 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  35.28 
 
 
414 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  38.34 
 
 
404 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  36.63 
 
 
414 aa  186  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4105  imidazolonepropionase  41.21 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  36.94 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  37.4 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  38.68 
 
 
395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  39.26 
 
 
420 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  37.89 
 
 
411 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  35.45 
 
 
429 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  38.24 
 
 
402 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  36.94 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  36.95 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>