More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1107 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  100 
 
 
392 aa  778    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  90.56 
 
 
392 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  72.21 
 
 
389 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  66.75 
 
 
393 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  66.75 
 
 
401 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  66.67 
 
 
469 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  67.45 
 
 
382 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  65.03 
 
 
382 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  65.39 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  65.32 
 
 
391 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  60.93 
 
 
391 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  61.18 
 
 
407 aa  411  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  58.4 
 
 
416 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  54.73 
 
 
400 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  59.69 
 
 
381 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  51.54 
 
 
454 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  54.41 
 
 
403 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  53.1 
 
 
401 aa  357  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  40.24 
 
 
423 aa  286  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  36.63 
 
 
424 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  41.12 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  37.01 
 
 
423 aa  245  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  40.35 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  39.42 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  41.56 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  40.15 
 
 
405 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  41.54 
 
 
408 aa  242  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  41.82 
 
 
408 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  41.18 
 
 
439 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  37.81 
 
 
403 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  40.78 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  33.17 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  36.44 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  35.68 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  40.74 
 
 
414 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  41.69 
 
 
411 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  40.31 
 
 
410 aa  232  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  35.14 
 
 
411 aa  232  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  35.7 
 
 
423 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  38.69 
 
 
414 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  42.76 
 
 
426 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  40.77 
 
 
408 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  35.45 
 
 
423 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  40.15 
 
 
425 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  39.64 
 
 
414 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  41.8 
 
 
406 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  34.96 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  40.92 
 
 
421 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  35.21 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
401 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  42.29 
 
 
411 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  34.96 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  42.74 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  37.25 
 
 
407 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  37.29 
 
 
414 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  43.9 
 
 
421 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  42.67 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  41.6 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  41.18 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  41.48 
 
 
421 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  31.6 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  31.6 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  34.72 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
401 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  38.54 
 
 
401 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  40.77 
 
 
399 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  42.18 
 
 
423 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  41.51 
 
 
407 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  41.51 
 
 
407 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  39.32 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  40.74 
 
 
407 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  39.31 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  36.08 
 
 
407 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  40.99 
 
 
407 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  41.51 
 
 
407 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  39.26 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  38.7 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  41.25 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  40.99 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  42.08 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>