47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1671 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  100 
 
 		 398 aa  796    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  84.42 
 
 		 399 aa  689    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  84.6 
 
 		 398 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  69.17 
 
 		 399 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  69.13 
 
 		 402 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  68.54 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  68.04 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  67.78 
 
 		 422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  48.57 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  45.14 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  23.94 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  32.32 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  32.32 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  33.82 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.13 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  31.31 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  30.25 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  42.42 
 
 		 541 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  27.35 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  34.38 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  42.55 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  41.56 
 
 		 555 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  22.06 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.45 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  38.89 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  38.75 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  37.76 
 
 		 530 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.2 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  27.44 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  30.19 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  36.7 
 
 		 1062 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  27.62 
 
 		 1111 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  31.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  38.46 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 550 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.36 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  25.74 
 
 		 595 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.56 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  32.48 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  39.24 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.75 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 629 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  26.74 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 410 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  34.62 
 
 		 441 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  31.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>