37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0577 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  100 
 
 
392 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  42.42 
 
 
387 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  49.35 
 
 
385 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  41.6 
 
 
398 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  42.86 
 
 
398 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  40.98 
 
 
399 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  39.53 
 
 
401 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  38.97 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  39.48 
 
 
402 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  39.64 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  39.64 
 
 
422 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  35.92 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  46.3 
 
 
574 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  47.17 
 
 
555 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  23.55 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  39.24 
 
 
401 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  38.1 
 
 
542 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  47.06 
 
 
576 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  43.86 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  41.67 
 
 
601 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2582  Amidohydrolase 3  34.34 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405161  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  42.11 
 
 
580 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  32.77 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  36.84 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  33.33 
 
 
585 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  31.06 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  41.67 
 
 
650 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  28.11 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  39.68 
 
 
559 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  38.78 
 
 
537 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  24.56 
 
 
551 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
549 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  39.68 
 
 
530 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  39.68 
 
 
530 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  39.68 
 
 
530 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  32.84 
 
 
583 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  32.84 
 
 
583 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>