More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0821 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  100 
 
 
401 aa  812    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0685  imidazolonepropionase  71.39 
 
 
402 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2271  imidazolonepropionase (imidazolone-5-propionate hydrolase)  67.66 
 
 
402 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3268  imidazolonepropionase  64.18 
 
 
404 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00728606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1141  imidazolonepropionase  63.43 
 
 
401 aa  482  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.775839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  38.12 
 
 
408 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  37.6 
 
 
410 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  37.6 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  37.86 
 
 
408 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  37.34 
 
 
408 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  39.12 
 
 
403 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  37.08 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  37.08 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  37.08 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  37.08 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  36.34 
 
 
445 aa  223  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  36.41 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  37.87 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  36.29 
 
 
415 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  35.18 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  37.47 
 
 
408 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  36.95 
 
 
401 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  36.95 
 
 
401 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  36.18 
 
 
401 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  37.37 
 
 
401 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  37.11 
 
 
406 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  37.16 
 
 
393 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  37.97 
 
 
423 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  36.27 
 
 
408 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  36.14 
 
 
403 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  36.24 
 
 
403 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  36.32 
 
 
420 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  37.01 
 
 
414 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  35.98 
 
 
403 aa  205  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  36.73 
 
 
414 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  35.57 
 
 
406 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  35.98 
 
 
403 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  37.11 
 
 
401 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  35.64 
 
 
401 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  34.47 
 
 
406 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  36.34 
 
 
402 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  36.86 
 
 
401 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  37.22 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  34.25 
 
 
417 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  37.73 
 
 
469 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  36.01 
 
 
402 aa  199  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  34.66 
 
 
425 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  35.99 
 
 
412 aa  199  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  33.58 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  38.08 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  34.76 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1483  imidazolonepropionase  36.5 
 
 
395 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  35.73 
 
 
382 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  36.43 
 
 
505 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  36.29 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  33.99 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  34.92 
 
 
424 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
446 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  36.13 
 
 
400 aa  196  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  33.99 
 
 
406 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  34.02 
 
 
407 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  34.37 
 
 
405 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  34.91 
 
 
420 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  37.5 
 
 
410 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  34.03 
 
 
402 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  35.71 
 
 
407 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  35.71 
 
 
407 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  31.82 
 
 
411 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  33.74 
 
 
406 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  35.73 
 
 
407 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  35.23 
 
 
407 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  35.35 
 
 
411 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  37.34 
 
 
405 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  35.24 
 
 
407 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  36.5 
 
 
410 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  34 
 
 
416 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  34.25 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  36.53 
 
 
407 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  34.87 
 
 
405 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  36.16 
 
 
382 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  36.98 
 
 
395 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  35.97 
 
 
404 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  34.96 
 
 
407 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  34.46 
 
 
431 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  35.01 
 
 
400 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  34.37 
 
 
405 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  33.16 
 
 
401 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  34.7 
 
 
407 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  32.19 
 
 
418 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  34.96 
 
 
407 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  32.53 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  36.18 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>