More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0685 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0685  imidazolonepropionase  100 
 
 
402 aa  812    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  71.39 
 
 
401 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3268  imidazolonepropionase  60.65 
 
 
404 aa  484  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00728606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2271  imidazolonepropionase (imidazolone-5-propionate hydrolase)  62.69 
 
 
402 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1141  imidazolonepropionase  58.96 
 
 
401 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.775839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  36.9 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  36.9 
 
 
408 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  36.9 
 
 
408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  36.64 
 
 
408 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  36.13 
 
 
410 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
408 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  36.13 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  36.13 
 
 
408 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  37.83 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  35.99 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  34.87 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  36.29 
 
 
408 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  37.4 
 
 
412 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  35.07 
 
 
403 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  35.16 
 
 
414 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  35.22 
 
 
408 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  34.41 
 
 
420 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  34.19 
 
 
406 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  37.73 
 
 
410 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  35.38 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  34.04 
 
 
445 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  36.25 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  34.92 
 
 
401 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  33.42 
 
 
406 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  33.42 
 
 
406 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  34.53 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  34.9 
 
 
414 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  34.68 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  33.17 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  34.75 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  37.17 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  37.47 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  35.88 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  34.06 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  37.18 
 
 
469 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  33.95 
 
 
401 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  33.58 
 
 
416 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  38.56 
 
 
414 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  34.48 
 
 
402 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  34.75 
 
 
401 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  33.76 
 
 
406 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  34.65 
 
 
399 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  33.77 
 
 
425 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  34.54 
 
 
411 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  35.77 
 
 
505 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  32.51 
 
 
417 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  35.22 
 
 
382 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  36.77 
 
 
411 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  34.13 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  34.39 
 
 
402 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  35.41 
 
 
402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  34.57 
 
 
401 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  33.91 
 
 
406 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  33.86 
 
 
403 aa  189  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  35.66 
 
 
410 aa  189  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  37.06 
 
 
426 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
401 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  33.76 
 
 
405 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  36.11 
 
 
411 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  33.99 
 
 
401 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  34.69 
 
 
404 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  31.35 
 
 
411 aa  186  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  36.04 
 
 
391 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  31.44 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  32.13 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  33.51 
 
 
431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  34.67 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  34.62 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  34.35 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  34.22 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  37.38 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  33.99 
 
 
389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  31.91 
 
 
401 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  35.18 
 
 
395 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  35.04 
 
 
421 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  32.25 
 
 
405 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  37.5 
 
 
402 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  33.76 
 
 
405 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
391 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  35.19 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  32.36 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  31.28 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  31.33 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  35.14 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  32.48 
 
 
446 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  34.16 
 
 
382 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  31.36 
 
 
423 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  36.63 
 
 
392 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>