272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1141 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1141  imidazolonepropionase  100 
 
 
401 aa  810    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.775839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2271  imidazolonepropionase (imidazolone-5-propionate hydrolase)  83.08 
 
 
402 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3268  imidazolonepropionase  69.9 
 
 
404 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00728606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0821  imidazolonepropionase  63.43 
 
 
401 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0685  imidazolonepropionase  58.96 
 
 
402 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  38.97 
 
 
403 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  36.6 
 
 
402 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  37.34 
 
 
411 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  33.74 
 
 
406 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  33.74 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  34.99 
 
 
408 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  34.38 
 
 
403 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  36.83 
 
 
402 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  36.2 
 
 
401 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  34.99 
 
 
410 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  35.99 
 
 
416 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  36.1 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  35.37 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  35.25 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  33.5 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  35.7 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  35.93 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  34.73 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  34.66 
 
 
408 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  35.25 
 
 
408 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  35.94 
 
 
401 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  34.39 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  34.39 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  34.39 
 
 
408 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  36.09 
 
 
382 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  35.68 
 
 
401 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  34.7 
 
 
401 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
407 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  35.88 
 
 
423 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  35.29 
 
 
401 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  33.42 
 
 
406 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  35.48 
 
 
425 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  37.03 
 
 
407 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  34.48 
 
 
403 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  34.58 
 
 
399 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  33.6 
 
 
445 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  36.57 
 
 
411 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  36.22 
 
 
505 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  34.2 
 
 
400 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  35.73 
 
 
391 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  34.02 
 
 
401 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  34.66 
 
 
424 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  33.42 
 
 
410 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  34.3 
 
 
408 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  37.5 
 
 
416 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  35.49 
 
 
414 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  33.51 
 
 
408 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  35.92 
 
 
416 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  33.96 
 
 
408 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  35.59 
 
 
407 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  35.59 
 
 
407 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  35.11 
 
 
410 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  35.73 
 
 
469 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  34.26 
 
 
401 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  35.18 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  35.59 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  31.66 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  35.38 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  34.07 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  34.75 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  33.58 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  32.99 
 
 
414 aa  183  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  34.24 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  32.43 
 
 
406 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  33.77 
 
 
403 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  31.05 
 
 
418 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  35.09 
 
 
407 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  33.67 
 
 
429 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  34.02 
 
 
412 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  34.31 
 
 
391 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  34.61 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  34.84 
 
 
407 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  31.85 
 
 
428 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  32.49 
 
 
418 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  33.62 
 
 
416 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  35.01 
 
 
426 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  30.85 
 
 
402 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  32.82 
 
 
404 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  34.41 
 
 
389 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  33.99 
 
 
407 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  31.64 
 
 
411 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  34.59 
 
 
407 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  35.09 
 
 
407 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  32.99 
 
 
405 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  35.52 
 
 
392 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  29.87 
 
 
446 aa  176  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  33.68 
 
 
414 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
420 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  34.72 
 
 
424 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>