More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2239 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  100 
 
 
392 aa  793    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  43.33 
 
 
468 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  43.63 
 
 
368 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  40.84 
 
 
399 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  38.73 
 
 
478 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  36.26 
 
 
432 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  35.98 
 
 
424 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  32.7 
 
 
414 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  32.62 
 
 
414 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  31.71 
 
 
415 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  34.79 
 
 
399 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.93 
 
 
420 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  34.24 
 
 
428 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  32.38 
 
 
421 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  32.58 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  31.25 
 
 
428 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  32.12 
 
 
299 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  32.77 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  30.84 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.43 
 
 
440 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  31.18 
 
 
368 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  37.64 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  38.01 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  33.71 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  29.19 
 
 
373 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  29.22 
 
 
442 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  26.79 
 
 
428 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.37 
 
 
441 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  31.54 
 
 
428 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  24.68 
 
 
462 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  29.58 
 
 
432 aa  99.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 
449 aa  99.4  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.17 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  27.45 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.3 
 
 
440 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  29.3 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.38 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  27.67 
 
 
416 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.75 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.13 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  25.69 
 
 
444 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.72 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.2 
 
 
484 aa  90.1  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.89 
 
 
444 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.13 
 
 
435 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.13 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25.13 
 
 
435 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25.13 
 
 
435 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.25 
 
 
451 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.13 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  28.92 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.61 
 
 
433 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.19 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.87 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  24.28 
 
 
451 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  28.1 
 
 
453 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  24.62 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  24.62 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  24.62 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  27.25 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.05 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.11 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.95 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  27.06 
 
 
432 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  27.22 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  24.14 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  28.11 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  27.09 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24 
 
 
432 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.93 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  27.09 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.96 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.74 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  24.63 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.04 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  24.63 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  20.36 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  22.22 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.91 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  25 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  25.69 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  25.43 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.51 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  24.62 
 
 
656 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.81 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  28.09 
 
 
444 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  26.36 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  23.3 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  26.67 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  25.57 
 
 
663 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.44 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  24.3 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.02 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  23.93 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  23.9 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.38 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  25.59 
 
 
660 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>