More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1645 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  81.16 
 
 
420 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  100 
 
 
421 aa  851    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  60.34 
 
 
415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  55.1 
 
 
414 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  55.34 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  50.73 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  50.13 
 
 
413 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  38.65 
 
 
428 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  34.08 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  30.82 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  33.25 
 
 
399 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  32.11 
 
 
424 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  30.73 
 
 
451 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  32.46 
 
 
392 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.36 
 
 
416 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  30.07 
 
 
457 aa  137  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  31.07 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  32.58 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  30.38 
 
 
368 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  31.66 
 
 
468 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  31.07 
 
 
432 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.72 
 
 
452 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  31.03 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  31.81 
 
 
368 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.85 
 
 
451 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.85 
 
 
484 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  30.67 
 
 
428 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  28.67 
 
 
663 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  31.29 
 
 
388 aa  122  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.46 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  26.7 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  30.04 
 
 
299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  27.86 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.11 
 
 
432 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.48 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  28.1 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  31.35 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  32.72 
 
 
444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  26.59 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.23 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  30.75 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.57 
 
 
433 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  30.77 
 
 
445 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  39.52 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.15 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.57 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.95 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  27.22 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  25.9 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.68 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  26.73 
 
 
656 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  27.64 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.22 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  25.63 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  27.03 
 
 
431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.72 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.51 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  28.1 
 
 
663 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  26.18 
 
 
422 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  30.13 
 
 
373 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.27 
 
 
447 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  27.85 
 
 
408 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1743  hydrolase, Atz/Trz family  29.02 
 
 
443 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  25.06 
 
 
406 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  30.58 
 
 
413 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  27.22 
 
 
428 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3649  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.05 
 
 
443 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  31.27 
 
 
431 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  29.26 
 
 
434 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.97 
 
 
429 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.06 
 
 
447 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  31.95 
 
 
399 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  26.22 
 
 
398 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.49 
 
 
426 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.68 
 
 
448 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.91 
 
 
428 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  28.32 
 
 
392 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.07 
 
 
432 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  26 
 
 
435 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  30.69 
 
 
440 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  29.69 
 
 
442 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  25.36 
 
 
407 aa  103  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.2 
 
 
441 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  25.27 
 
 
408 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.75 
 
 
440 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.32 
 
 
447 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  25.46 
 
 
431 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  28.28 
 
 
459 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.33 
 
 
444 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.03 
 
 
441 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  27.35 
 
 
422 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  28.72 
 
 
441 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  23.85 
 
 
436 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  28.72 
 
 
441 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  27.52 
 
 
384 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.21 
 
 
455 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  27.03 
 
 
451 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.37 
 
 
444 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.01 
 
 
458 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>