More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0252 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  100 
 
 
368 aa  737    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  43.63 
 
 
392 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  41.64 
 
 
468 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  39.45 
 
 
399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.59 
 
 
478 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  38.24 
 
 
399 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  35.09 
 
 
432 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  32.89 
 
 
415 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  33.85 
 
 
428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  32.35 
 
 
414 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  33.51 
 
 
428 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  33.07 
 
 
414 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  34.09 
 
 
413 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  31.99 
 
 
420 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  35.37 
 
 
424 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  37.03 
 
 
416 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  33.33 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.65 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  37.5 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  35.92 
 
 
412 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  35.39 
 
 
412 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  34.86 
 
 
412 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  29.39 
 
 
299 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  31.83 
 
 
432 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.95 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  29.2 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  32.65 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  29.12 
 
 
663 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  29.54 
 
 
408 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  26.67 
 
 
451 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.38 
 
 
441 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  29.38 
 
 
656 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  25.61 
 
 
428 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.79 
 
 
442 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 
452 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  25.07 
 
 
420 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  31.27 
 
 
368 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.82 
 
 
451 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.82 
 
 
484 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  27.59 
 
 
436 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  29.23 
 
 
428 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.2 
 
 
439 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  26.56 
 
 
660 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  29.94 
 
 
440 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.82 
 
 
432 aa  99.4  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.87 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  24.93 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.42 
 
 
439 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  28.09 
 
 
663 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.51 
 
 
428 aa  96.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  28.95 
 
 
447 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  24.8 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.26 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  26.15 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  27.4 
 
 
392 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  27.3 
 
 
421 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  26.01 
 
 
435 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
464 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.79 
 
 
440 aa  92.8  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.27 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.23 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  29.07 
 
 
373 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.85 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  25.84 
 
 
431 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.03 
 
 
469 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  28.9 
 
 
453 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  26.76 
 
 
413 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.64 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0362  chlorohydrolase  28.05 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  25.89 
 
 
434 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.1 
 
 
441 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.27 
 
 
430 aa  86.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  22.77 
 
 
444 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  25.63 
 
 
406 aa  86.3  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0064  chlorohydrolase  26.15 
 
 
409 aa  85.9  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  29.43 
 
 
457 aa  85.9  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.49 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  26.59 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0686  chlorohydrolase  25.74 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.777216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.87 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  27.71 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.81 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.84 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 
470 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  34.33 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  26.49 
 
 
441 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1502  amidohydrolase  26.49 
 
 
441 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199734  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0105  chlorohydrolase  26.15 
 
 
409 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.81 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  29.35 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  26.77 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  26.05 
 
 
478 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.11 
 
 
470 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1566  amidohydrolase  23.12 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0077  chlorohydrolase  26.15 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.63 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.53 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>