More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1424 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  100 
 
 
478 aa  925    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  53.25 
 
 
399 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  48.23 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  40.76 
 
 
432 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  38.73 
 
 
392 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  40.69 
 
 
368 aa  210  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  33.82 
 
 
424 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  36.73 
 
 
399 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  32.59 
 
 
428 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 
428 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  31.19 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  30.83 
 
 
415 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  31.68 
 
 
414 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  32.9 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.79 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  29.31 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  33.99 
 
 
416 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.18 
 
 
442 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  29.57 
 
 
299 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 
484 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  30.03 
 
 
416 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.85 
 
 
451 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  26.27 
 
 
413 aa  101  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  24.69 
 
 
451 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0782  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.2 
 
 
460 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.026744  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.2 
 
 
447 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.65 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.02 
 
 
448 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  30.36 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  36.48 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.23 
 
 
449 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  48.53 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  35.5 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  25.27 
 
 
431 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  28.5 
 
 
432 aa  93.6  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2584  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
465 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934679  normal  0.607445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  39.35 
 
 
368 aa  93.2  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  36.77 
 
 
373 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3132  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.92 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.34 
 
 
433 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  31.06 
 
 
452 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.75 
 
 
454 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  44.93 
 
 
441 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  35.21 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2119  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.72 
 
 
474 aa  91.3  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438847  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  37.59 
 
 
440 aa  90.5  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.32 
 
 
438 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3262  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.81 
 
 
457 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.36 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.561971  normal  0.0500608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2259  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.36 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.57 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  44.2 
 
 
449 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.66 
 
 
469 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  25.67 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.79 
 
 
455 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.2 
 
 
446 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.3 
 
 
461 aa  87  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  27.68 
 
 
392 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  31.81 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.52 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.42 
 
 
451 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  29.19 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  24.94 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  32.5 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  38.41 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  35.71 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.02 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.99 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  43.14 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1029  amidohydrolase  35.61 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.951911  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  37.41 
 
 
446 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  22.66 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  44.68 
 
 
439 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.03 
 
 
465 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  27.63 
 
 
388 aa  84  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  39.13 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1575  N-ethylammeline chlorohydrolase  41.83 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.79 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  40.56 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1632  N-ethylammeline chlorohydrolase  41.83 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  26.99 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.46 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  32.86 
 
 
458 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  28.54 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.77 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  47.73 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.44 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  30.49 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  28.73 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.69 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.03 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.73 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  24.74 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  20.81 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.23 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.83 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  30.84 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  34.05 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>