More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1275 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  100 
 
 
399 aa  811    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  36.99 
 
 
424 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  37.68 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0465  amidohydrolase  40.06 
 
 
399 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.742317  normal  0.0452938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  35.1 
 
 
428 aa  166  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  37.76 
 
 
468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  33.59 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  34.62 
 
 
432 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  33.25 
 
 
421 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  33.33 
 
 
420 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  34.79 
 
 
392 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  35.67 
 
 
299 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  32.76 
 
 
413 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  31.82 
 
 
414 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  34.93 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  32.55 
 
 
416 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  30.21 
 
 
414 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3845  amidohydrolase  30.61 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.86 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1424  amidohydrolase  40.74 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  29.44 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.07 
 
 
434 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  31.79 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0441  amidohydrolase  27.15 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.24 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0370  amidohydrolase 1  32.55 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  31.75 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.77 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.26 
 
 
440 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.31 
 
 
439 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  26.88 
 
 
457 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  27.15 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.36 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  28.57 
 
 
428 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  32.26 
 
 
368 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  31.83 
 
 
412 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.36 
 
 
484 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  26.49 
 
 
451 aa  109  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.84 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.66 
 
 
468 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.14 
 
 
452 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  27.43 
 
 
431 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  24.62 
 
 
420 aa  107  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1504  chlorohydrolase  25.82 
 
 
406 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.79 
 
 
447 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  28.19 
 
 
442 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.54 
 
 
441 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  30.33 
 
 
430 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0042  amidohydrolase  28.74 
 
 
426 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  31.65 
 
 
473 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.01 
 
 
448 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  27.14 
 
 
432 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  27.3 
 
 
413 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.52 
 
 
432 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  29.36 
 
 
388 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  29.81 
 
 
428 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2149  N-ethylammeline chlorohydrolase  32.2 
 
 
446 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.450112  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 
444 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.18 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  27.78 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.85 
 
 
439 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0289  amidohydrolase  28.19 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0371  chlorohydrolase  24.25 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0102343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1212  chlorohydrolase  24.55 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.39 
 
 
440 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0362  chlorohydrolase  26.38 
 
 
404 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0746699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  24.55 
 
 
398 aa  96.7  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3188  amidohydrolase  30.02 
 
 
598 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.06 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 
464 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  24.66 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.66 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  28.4 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0603  amidohydrolase  26.61 
 
 
382 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  28.21 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.86 
 
 
442 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.51 
 
 
429 aa  93.2  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  25.2 
 
 
431 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.14 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  25.95 
 
 
663 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.75 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2741  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.56 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00380  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 
449 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  29.06 
 
 
445 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  26.59 
 
 
443 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.32 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  25.99 
 
 
458 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  26.22 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.12 
 
 
444 aa  87  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  24.93 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  23.75 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.54 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.54 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  26.28 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  27.89 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  24.68 
 
 
656 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2295  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.73 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.853343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  28.36 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15770  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.07 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0064  chlorohydrolase  27.36 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>