More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0873 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0873  cytosine deaminase  100 
 
 
457 aa  939    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.291965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8785  amidohydrolase  42.99 
 
 
428 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.988159  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8056  amidohydrolase  37.78 
 
 
428 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0961  amidohydrolase  28.47 
 
 
413 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1645  Atz/Trz family chlorohydrolase  30.07 
 
 
421 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1708  Atz/Trz family chlorohydrolase  28.47 
 
 
420 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0266273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2081  amidohydrolase  29.85 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6873  Cytosine deaminase and related metal-dependent hydrolase-like protein  27.64 
 
 
351 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1971  amidohydrolase  28.8 
 
 
416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3409  amidohydrolase  28.06 
 
 
428 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00196752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  29.47 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1241  amidohydrolase  28.19 
 
 
414 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29686e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1827  cytosine deaminase/metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0600638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3009  amidohydrolase  27.8 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4208  amidohydrolase  32.85 
 
 
416 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00909299  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1275  amidohydrolase  26.88 
 
 
399 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.68 
 
 
440 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  29.71 
 
 
447 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2834  amidohydrolase  24.83 
 
 
451 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.55 
 
 
449 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1825  amidohydrolase  31.53 
 
 
368 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.629302  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.74 
 
 
448 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.1 
 
 
439 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  26.78 
 
 
451 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.04 
 
 
439 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2963  amidohydrolase family protein  29.07 
 
 
468 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  24.77 
 
 
398 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  25.66 
 
 
431 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24 
 
 
444 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.02 
 
 
432 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.52 
 
 
444 aa  99.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1743  S-adenosylhomocysteine deaminase  28 
 
 
373 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  26.97 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  28.57 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  26.32 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.01 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.27 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  25.12 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  27.75 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  28.01 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  28.01 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  24.87 
 
 
432 aa  96.7  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  27.75 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  27.75 
 
 
435 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.71 
 
 
469 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.76 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.68 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  24.94 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  27.49 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  27.49 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0398  amidohydrolase  31.42 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.535979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  23.45 
 
 
462 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  27.09 
 
 
449 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0576  amidohydrolase  28.57 
 
 
388 aa  93.6  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  27.23 
 
 
435 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.71 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  26.27 
 
 
663 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.97 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.39 
 
 
434 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  28.37 
 
 
434 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  27.67 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  26.96 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  26.89 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.97 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0399  amidohydrolase  31.12 
 
 
412 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.408969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  29.01 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  25.92 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  27.63 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1810  amidohydrolase  25.8 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1577  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.04 
 
 
455 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0236916  unclonable  0.000000239085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1874  amidohydrolase  27.32 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  29.51 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.48 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.87 
 
 
430 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.28 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  23.23 
 
 
468 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2494  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.53 
 
 
442 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.57 
 
 
446 aa  86.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  25.9 
 
 
457 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  29.21 
 
 
444 aa  86.3  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  25.25 
 
 
434 aa  86.7  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  24.94 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.17 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  25.97 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  23.79 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.55 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.53 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  27.92 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.11 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  23.98 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  23.57 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  22.46 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0574  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.19 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0252  amidohydrolase  27.88 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00951952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.86 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3087  amidohydrolase  24.32 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000127453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0024  amidohydrolase  26.96 
 
 
299 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  25.47 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0229  chlorohydrolase  22.44 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  26.37 
 
 
660 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>