More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3813 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3813  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
554 aa  1109    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2718  glycosyl transferase group 1  46.6 
 
 
498 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  43.3 
 
 
996 aa  277  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.04 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
402 aa  65.1  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
440 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  29.72 
 
 
385 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  29.41 
 
 
373 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
392 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
366 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
322 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
375 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
348 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
362 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
386 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1267 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
382 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
419 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
395 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
383 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
360 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  30.93 
 
 
344 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  23.66 
 
 
411 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  26.16 
 
 
427 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
377 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
404 aa  57.4  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
358 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
382 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1603  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.535279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
371 aa  57  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
439 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
371 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
379 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
380 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
391 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.96 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
388 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25.96 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
366 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
388 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
383 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 
380 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.47 
 
 
386 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  28.44 
 
 
411 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.16 
 
 
375 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
370 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
379 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
385 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
369 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
382 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.85 
 
 
396 aa  55.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
373 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
362 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
344 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.22 
 
 
362 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.58 
 
 
365 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
389 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
367 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  29.84 
 
 
480 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
535 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
380 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
380 aa  54.3  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
379 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
399 aa  54.3  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
380 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
405 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
409 aa  53.9  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  25.25 
 
 
428 aa  53.9  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
381 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 
380 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
349 aa  53.5  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
448 aa  53.5  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
364 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
382 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
399 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  27.65 
 
 
399 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
403 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.21 
 
 
380 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
446 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
439 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
426 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
439 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0725  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
377 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>