More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2718 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2718  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 498 aa  997    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3813  glycosyl transferase group 1  46.6 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  42.23 
 
 		 996 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.46 
 
 		 349 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 366 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  32.5 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  26.48 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.79 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  29.17 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 366 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 387 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.66 
 
 		 364 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  25.85 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  23.91 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 689 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  41.74 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  41.74 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 389 aa  62  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 386 aa  62  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 1080 aa  61.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  41.46 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.6 
 
 		 349 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  26.78 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  22.9 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 821 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  34.48 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0723  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>