More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1907 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
406 aa  811    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.15 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.87 
 
 
419 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  50.25 
 
 
419 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  50 
 
 
426 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  50 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  50 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  50 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  48.77 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.77 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  50.13 
 
 
438 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  51.01 
 
 
415 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.99 
 
 
413 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.87 
 
 
438 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.87 
 
 
438 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.61 
 
 
438 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.61 
 
 
438 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  47.87 
 
 
434 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  47.99 
 
 
419 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.4 
 
 
412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.62 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  47.49 
 
 
419 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  46.4 
 
 
412 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.37 
 
 
420 aa  325  7e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.89 
 
 
416 aa  325  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  47.99 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  43.87 
 
 
412 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.41 
 
 
412 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.28 
 
 
413 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.12 
 
 
407 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.6 
 
 
416 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.75 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.5 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  44.11 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.13 
 
 
415 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.74 
 
 
423 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  48.86 
 
 
423 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.86 
 
 
423 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  46.19 
 
 
407 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.72 
 
 
407 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  42 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.53 
 
 
407 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.33 
 
 
417 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.93 
 
 
412 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.04 
 
 
422 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.59 
 
 
409 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  44.01 
 
 
412 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.38 
 
 
403 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  43.38 
 
 
400 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.38 
 
 
400 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.22 
 
 
409 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 
405 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.16 
 
 
405 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  38.34 
 
 
405 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  40 
 
 
405 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40 
 
 
405 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.89 
 
 
405 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.16 
 
 
451 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  35.58 
 
 
412 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.09 
 
 
416 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.55 
 
 
407 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  35.88 
 
 
425 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.83 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.57 
 
 
412 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  35.68 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
412 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
412 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
412 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
412 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.39 
 
 
393 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
451 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.85 
 
 
412 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  34.04 
 
 
412 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.04 
 
 
412 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.26 
 
 
405 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  35.31 
 
 
405 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.23 
 
 
412 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  35.12 
 
 
406 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.1 
 
 
393 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.12 
 
 
393 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.04 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.86 
 
 
401 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  34.21 
 
 
418 aa  182  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.31 
 
 
412 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.14 
 
 
424 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.06 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.41 
 
 
400 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 
413 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.41 
 
 
404 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.04 
 
 
399 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  33.51 
 
 
420 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 
413 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.9 
 
 
425 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.93 
 
 
410 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 
404 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.49 
 
 
404 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.71 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>