More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5260 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 
426 aa  861    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  87.92 
 
 
434 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  70.8 
 
 
438 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.53 
 
 
438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.29 
 
 
438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.29 
 
 
438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.53 
 
 
438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50 
 
 
406 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.88 
 
 
436 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.03 
 
 
420 aa  305  7e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.83 
 
 
403 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.49 
 
 
420 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.23 
 
 
437 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.67 
 
 
416 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  43.01 
 
 
419 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.23 
 
 
415 aa  279  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  42.49 
 
 
419 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.58 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  39.32 
 
 
412 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.48 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.15 
 
 
419 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.84 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  40.99 
 
 
412 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.56 
 
 
413 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  41.35 
 
 
419 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.05 
 
 
407 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  39.95 
 
 
408 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  41.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  41.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  41.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  41.1 
 
 
419 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.43 
 
 
412 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.61 
 
 
407 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  38.6 
 
 
412 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.45 
 
 
415 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.64 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.26 
 
 
407 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  41.19 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.52 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.19 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.26 
 
 
417 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.52 
 
 
423 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.88 
 
 
408 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.83 
 
 
409 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.26 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  38.29 
 
 
412 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.94 
 
 
412 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.62 
 
 
451 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.58 
 
 
403 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.88 
 
 
416 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.79 
 
 
400 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.79 
 
 
400 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  32.18 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  35.56 
 
 
425 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.73 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.73 
 
 
405 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.13 
 
 
405 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.86 
 
 
409 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.57 
 
 
405 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  34.14 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.04 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 
407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.08 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.52 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.08 
 
 
412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.08 
 
 
412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.89 
 
 
412 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.58 
 
 
405 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
451 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.3 
 
 
405 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 
393 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  33.33 
 
 
405 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.69 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  31.82 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.88 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.9 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  33.24 
 
 
406 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 
393 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  31.6 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.9 
 
 
410 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  32.61 
 
 
413 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.08 
 
 
401 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.81 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.51 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.73 
 
 
415 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  32.49 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.7 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.69 
 
 
440 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.35 
 
 
401 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.08 
 
 
433 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 
403 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>