More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3661 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  97.79 
 
 		 407 aa  764    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 		 407 aa  803    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  77.89 
 
 		 407 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  71.36 
 
 		 407 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  71.11 
 
 		 407 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  65.52 
 
 		 407 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  61.03 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  61.06 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.46 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  53.32 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  56.14 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  56.83 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.9 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.06 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  53.57 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  52.94 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.57 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  53.57 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  53.57 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  48.98 
 
 		 412 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  52.94 
 
 		 419 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.72 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  50.89 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  50.89 
 
 		 419 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.1 
 
 		 413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  48.21 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.96 
 
 		 412 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.65 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  51.79 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.79 
 
 		 423 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.53 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.97 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.95 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.76 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.86 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.88 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  40.52 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.84 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.52 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.01 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.89 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.89 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  40.62 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.62 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 		 409 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  36.73 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  41.58 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  36.93 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.93 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.93 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.27 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.64 
 
 		 451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.47 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.47 
 
 		 412 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.47 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.66 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.46 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.12 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.23 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  35.31 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  37.23 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.08 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.6 
 
 		 405 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.39 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.15 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.77 
 
 		 413 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  34.96 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.29 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.4 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.94 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.69 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.87 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.33 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.7 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.31 
 
 		 404 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  34.13 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.13 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.31 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  37.17 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  33.93 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.42 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  36.64 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.64 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.04 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.78 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  34.47 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.97 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.7 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.77 
 
 		 404 aa  183  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>