More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3354 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 415 aa  827    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  64.62 
 
 		 403 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  51.01 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.61 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  48.35 
 
 		 420 aa  328  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  49.76 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.13 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  46.67 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  48.85 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  45.13 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  46.83 
 
 		 419 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.62 
 
 		 413 aa  312  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.89 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  46.83 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.82 
 
 		 416 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.68 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.59 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.23 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  47.42 
 
 		 419 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.97 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  47.16 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.78 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  46.91 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  46.91 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  46.91 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  41.56 
 
 		 434 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.04 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.73 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.83 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.56 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.56 
 
 		 438 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  44.82 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.3 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.3 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.49 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.75 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.73 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.09 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  41.62 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.09 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.76 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  45.97 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.97 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.84 
 
 		 407 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.27 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.86 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.01 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  38.59 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.45 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  42.04 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.56 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.41 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  40.16 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.16 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.41 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  41.41 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  37.13 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.19 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.19 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.39 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.57 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.52 
 
 		 416 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.79 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.79 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.79 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.25 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.73 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.09 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.16 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.3 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.64 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  32.42 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32.64 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.43 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.69 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.71 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  32.31 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.6 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.83 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.3 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.19 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.2 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  32.6 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.73 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.6 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.87 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  30.69 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  30.89 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.53 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>