More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3100 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
392 aa  805    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.51 
 
 
412 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.63 
 
 
451 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.19 
 
 
412 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.63 
 
 
412 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.05 
 
 
424 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.36 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.36 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.36 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.36 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  43.69 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.69 
 
 
412 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  45.83 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  45.57 
 
 
411 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  46.47 
 
 
414 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.2 
 
 
440 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.04 
 
 
407 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  42.04 
 
 
425 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.12 
 
 
413 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  44.5 
 
 
412 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  41.25 
 
 
405 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.5 
 
 
413 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.56 
 
 
415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.67 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  43.78 
 
 
413 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  40.99 
 
 
405 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  43.56 
 
 
440 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.87 
 
 
405 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.89 
 
 
393 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.26 
 
 
413 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.16 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.49 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.76 
 
 
418 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  40.1 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  40.25 
 
 
420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.1 
 
 
393 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.78 
 
 
429 aa  319  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.96 
 
 
416 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.67 
 
 
415 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.6 
 
 
403 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.51 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.11 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.32 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.43 
 
 
419 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
404 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
400 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
404 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.01 
 
 
401 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.17 
 
 
419 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.82 
 
 
404 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  41.86 
 
 
411 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.82 
 
 
404 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  41.86 
 
 
411 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.82 
 
 
400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.19 
 
 
413 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.62 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.86 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  39.68 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.78 
 
 
417 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 
422 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.62 
 
 
433 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  41.6 
 
 
416 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.25 
 
 
426 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.62 
 
 
417 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  38.8 
 
 
420 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
413 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.44 
 
 
434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.38 
 
 
403 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.23 
 
 
430 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.49 
 
 
425 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.07 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.32 
 
 
395 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.73 
 
 
393 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.58 
 
 
425 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  38.56 
 
 
414 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  41.54 
 
 
326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.48 
 
 
395 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.39 
 
 
413 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.24 
 
 
411 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40 
 
 
412 aa  262  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.97 
 
 
420 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.76 
 
 
398 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.51 
 
 
398 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.51 
 
 
398 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.32 
 
 
395 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  36.55 
 
 
403 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.17 
 
 
415 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.32 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.34 
 
 
409 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.04 
 
 
410 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.19 
 
 
411 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.19 
 
 
411 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.19 
 
 
411 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.39 
 
 
436 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 
451 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.08 
 
 
390 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.36 
 
 
416 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.24 
 
 
375 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.33 
 
 
448 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.48 
 
 
407 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>