More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0238 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  99.49 
 
 		 406 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  83.08 
 
 		 401 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  82.05 
 
 		 401 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  96.69 
 
 		 393 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  83.12 
 
 		 397 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 393 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  88.55 
 
 		 393 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  75.51 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  70.77 
 
 		 402 aa  549  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  71.39 
 
 		 405 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  70.62 
 
 		 405 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  64.81 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  58.4 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.4 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.66 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  56.33 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  55.67 
 
 		 405 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.33 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.59 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.59 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.33 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.33 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.33 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.33 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  57.94 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  58.65 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.32 
 
 		 407 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.27 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.27 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.27 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  55.41 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  53.91 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.87 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.79 
 
 		 416 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  54.03 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  50.39 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.35 
 
 		 403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.73 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.25 
 
 		 410 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.54 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.54 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.39 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  53.08 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.35 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.44 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.47 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  52.47 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  53.65 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  53.65 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.86 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.82 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.31 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  52.31 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  51.79 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.73 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  50.76 
 
 		 440 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.54 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  53.87 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.99 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.26 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.31 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.34 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.34 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.6 
 
 		 419 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.16 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  52.96 
 
 		 326 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  49.1 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.9 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.8 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.98 
 
 		 413 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.78 
 
 		 418 aa  339  4e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.87 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.1 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.07 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 		 420 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.56 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.73 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.27 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  46.63 
 
 		 403 aa  281  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.41 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.11 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  42.61 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.61 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.36 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.46 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  38.1 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.1 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.83 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.16 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.16 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.16 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  35.19 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.98 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.21 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.47 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>