More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2667 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 407 aa  811    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  90.91 
 
 		 407 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.91 
 
 		 407 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.1 
 
 		 407 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  66.42 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  71.36 
 
 		 407 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  65.02 
 
 		 416 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  63.46 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  63.7 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  55.06 
 
 		 408 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  58 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  57.66 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  54.55 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  54.55 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  54.55 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  54.55 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.55 
 
 		 419 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  54.55 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.35 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.79 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  51.77 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  48.48 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  51.77 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.11 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  49.87 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.09 
 
 		 412 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 		 413 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  48.6 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.64 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.89 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  50.77 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.77 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.12 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.54 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.78 
 
 		 415 aa  282  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.54 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.69 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  41.18 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.06 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.93 
 
 		 422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.93 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.93 
 
 		 438 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.93 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.93 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  41.67 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  41.6 
 
 		 412 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.8 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  39.08 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.08 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.81 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.98 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  35.43 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  38.23 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.23 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.23 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  37 
 
 		 405 aa  213  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.73 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  36.66 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.31 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.32 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.51 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  35.22 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.72 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.98 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.54 
 
 		 402 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  34.53 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  35.22 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.78 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.55 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  31.75 
 
 		 412 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.75 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.49 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.51 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  33.59 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.78 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.25 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.96 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.82 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  34.36 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.69 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.96 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.69 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.61 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.35 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  33.16 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.56 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>