More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6516 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  89.6 
 
 
423 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  100 
 
 
423 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
423 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  97.4 
 
 
415 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  73.53 
 
 
419 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  73.77 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  73.77 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  73.77 
 
 
419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  73.77 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.77 
 
 
419 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  73.53 
 
 
419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  62.25 
 
 
412 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  60.39 
 
 
412 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  62.01 
 
 
412 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  64 
 
 
413 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  63.26 
 
 
412 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  60.64 
 
 
412 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  64.52 
 
 
419 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  64.52 
 
 
419 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  60.7 
 
 
413 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  55.36 
 
 
416 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  51.92 
 
 
408 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  53.65 
 
 
420 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.4 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 
407 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.67 
 
 
407 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.42 
 
 
407 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.64 
 
 
408 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.89 
 
 
407 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.51 
 
 
407 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.79 
 
 
416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.14 
 
 
422 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 
417 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.88 
 
 
406 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.41 
 
 
436 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.54 
 
 
420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.04 
 
 
415 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  42.75 
 
 
434 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.99 
 
 
438 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.99 
 
 
438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  43.99 
 
 
438 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.73 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.73 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.45 
 
 
426 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.62 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.11 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  37.78 
 
 
412 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  40.57 
 
 
412 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.39 
 
 
403 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  41.39 
 
 
400 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.39 
 
 
400 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
412 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.3 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  38.71 
 
 
405 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.71 
 
 
405 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.43 
 
 
405 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  38.4 
 
 
405 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.22 
 
 
407 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.12 
 
 
405 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  34.22 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  35.73 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  36.32 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.93 
 
 
409 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.19 
 
 
416 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.88 
 
 
451 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.75 
 
 
399 aa  203  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.36 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.09 
 
 
412 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.09 
 
 
412 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.93 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.67 
 
 
405 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.24 
 
 
413 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.78 
 
 
412 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.75 
 
 
425 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  34.76 
 
 
420 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.22 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.46 
 
 
405 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.7 
 
 
440 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.78 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.78 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.56 
 
 
407 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.06 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.67 
 
 
412 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.72 
 
 
393 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
404 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
404 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
400 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.24 
 
 
404 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.88 
 
 
416 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.28 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.03 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32.36 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.01 
 
 
415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>