More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2768 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
407 aa  823    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  66.42 
 
 
407 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  66.01 
 
 
407 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  65.52 
 
 
407 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  64.44 
 
 
407 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  63.3 
 
 
407 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  62.69 
 
 
416 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  61.92 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.61 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  53.33 
 
 
408 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  54.86 
 
 
420 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  53.77 
 
 
416 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.61 
 
 
437 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.24 
 
 
412 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  49.24 
 
 
412 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  50.38 
 
 
419 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  51.79 
 
 
419 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.65 
 
 
419 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  51.65 
 
 
419 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  51.65 
 
 
419 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  51.65 
 
 
419 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  51.65 
 
 
419 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  50.13 
 
 
419 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.51 
 
 
419 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  47.67 
 
 
412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.22 
 
 
412 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.6 
 
 
413 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.99 
 
 
413 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 
415 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  50 
 
 
423 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 
423 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.37 
 
 
423 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.5 
 
 
406 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.1 
 
 
422 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.12 
 
 
436 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.73 
 
 
415 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  39.95 
 
 
434 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.14 
 
 
420 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.05 
 
 
426 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.35 
 
 
403 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
438 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
438 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.57 
 
 
438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  40.31 
 
 
438 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.76 
 
 
409 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  39.95 
 
 
412 aa  230  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.5 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.31 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  36.04 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.04 
 
 
405 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  34.51 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  34.86 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.71 
 
 
412 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.62 
 
 
451 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.5 
 
 
405 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.76 
 
 
403 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.76 
 
 
400 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.76 
 
 
400 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.91 
 
 
405 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.52 
 
 
407 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
416 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
412 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.9 
 
 
405 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.06 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  34.87 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.09 
 
 
412 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.09 
 
 
412 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.82 
 
 
412 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
412 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
412 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
451 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
412 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
412 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  34.36 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.26 
 
 
412 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.27 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  32.53 
 
 
412 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.97 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  32.04 
 
 
418 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  33.25 
 
 
414 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
410 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31 
 
 
413 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  31.82 
 
 
425 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.35 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.16 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.69 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.64 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.55 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  32.9 
 
 
420 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.79 
 
 
415 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.03 
 
 
413 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.05 
 
 
407 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  32.29 
 
 
413 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.15 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  31.35 
 
 
406 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32.9 
 
 
405 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.35 
 
 
393 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>