More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1248 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  100 
 
 		 438 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.32 
 
 		 438 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.09 
 
 		 438 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.09 
 
 		 438 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.09 
 
 		 438 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  70.46 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  70.47 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.13 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.88 
 
 		 436 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.58 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.56 
 
 		 420 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.04 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.57 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.5 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.76 
 
 		 416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.05 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  43.78 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  43.78 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.78 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  41.94 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  43.78 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  43.78 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.82 
 
 		 415 aa  270  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  40.51 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.25 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  43.26 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  40.52 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  41.18 
 
 		 419 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.59 
 
 		 413 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.1 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.25 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  40 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  43.99 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.99 
 
 		 423 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  40.26 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  41.03 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.31 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.64 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.67 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.15 
 
 		 407 aa  245  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.95 
 
 		 408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.73 
 
 		 409 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  40.62 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.36 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.28 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.15 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.81 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.9 
 
 		 412 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.9 
 
 		 412 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  34.74 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.31 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  39.85 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.38 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.05 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.05 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  38.3 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.3 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.69 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.5 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  37.94 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.08 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.77 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  36.53 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.11 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.19 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.42 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.68 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  35.92 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.92 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  35.66 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.1 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.15 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.66 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.54 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.64 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  32.64 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.15 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.41 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  35.4 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.6 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  35.66 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.99 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.28 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.68 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.96 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.14 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  34.49 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  33.66 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.81 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  31.8 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.65 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>