More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2992 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  100 
 
 
412 aa  836    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  92.96 
 
 
412 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  72.07 
 
 
413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  65.76 
 
 
412 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  68.93 
 
 
412 aa  557  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  65.76 
 
 
412 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  70.79 
 
 
419 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  69.8 
 
 
419 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  65.75 
 
 
413 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  64.39 
 
 
419 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.39 
 
 
419 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  64.23 
 
 
419 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  64.39 
 
 
419 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  64.39 
 
 
419 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  64.39 
 
 
419 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  63.9 
 
 
419 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  63.66 
 
 
423 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  62.25 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  62.22 
 
 
423 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  62.22 
 
 
423 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.3 
 
 
420 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.04 
 
 
437 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  50.36 
 
 
416 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 
408 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  50.38 
 
 
408 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.22 
 
 
407 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.47 
 
 
407 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.09 
 
 
407 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.01 
 
 
416 aa  346  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.09 
 
 
407 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.96 
 
 
407 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.04 
 
 
417 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.96 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  49.49 
 
 
422 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.4 
 
 
406 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.75 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.68 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.83 
 
 
403 aa  292  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.94 
 
 
420 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  38.85 
 
 
426 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  40.1 
 
 
434 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  40 
 
 
438 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.74 
 
 
438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  41.27 
 
 
412 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.19 
 
 
409 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.12 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.33 
 
 
412 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  37.81 
 
 
405 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.54 
 
 
405 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  36.81 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  37.43 
 
 
405 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.43 
 
 
405 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.43 
 
 
405 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.89 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.99 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.89 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.89 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.93 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.16 
 
 
399 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.01 
 
 
405 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.59 
 
 
405 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  33.41 
 
 
418 aa  209  8e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.14 
 
 
412 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 
412 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.41 
 
 
412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.41 
 
 
412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.41 
 
 
412 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.41 
 
 
412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.16 
 
 
412 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
412 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.14 
 
 
451 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.64 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.14 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.81 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.78 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.84 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.48 
 
 
409 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32.84 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.61 
 
 
393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.05 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  35.79 
 
 
404 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  34.56 
 
 
406 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.25 
 
 
425 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.56 
 
 
393 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.7 
 
 
413 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  34.45 
 
 
408 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.87 
 
 
415 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.46 
 
 
424 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.68 
 
 
403 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.79 
 
 
440 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.14 
 
 
407 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.66 
 
 
400 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.66 
 
 
404 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.66 
 
 
404 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.51 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.46 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
404 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>