More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0553 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
413 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  72.86 
 
 
412 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  70.66 
 
 
412 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  72.07 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  67.73 
 
 
412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  67.73 
 
 
412 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.17 
 
 
419 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  69.17 
 
 
419 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.52 
 
 
413 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  69.17 
 
 
419 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  69.17 
 
 
419 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  69.17 
 
 
419 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  68.93 
 
 
419 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  70.32 
 
 
419 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  70.07 
 
 
419 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  67.8 
 
 
419 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  65.29 
 
 
423 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  64.25 
 
 
415 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  63.98 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  63.98 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.67 
 
 
420 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.93 
 
 
416 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.67 
 
 
437 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  48.21 
 
 
408 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
408 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.99 
 
 
407 aa  359  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50 
 
 
407 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.84 
 
 
407 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.24 
 
 
416 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  50.13 
 
 
422 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.98 
 
 
407 aa  336  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.99 
 
 
406 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.92 
 
 
417 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.97 
 
 
407 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.72 
 
 
407 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.09 
 
 
436 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.62 
 
 
415 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.34 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.97 
 
 
403 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  41.71 
 
 
434 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.56 
 
 
426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.59 
 
 
438 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.59 
 
 
438 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  40.59 
 
 
438 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.57 
 
 
409 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.35 
 
 
438 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.35 
 
 
438 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  42.5 
 
 
412 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.12 
 
 
412 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.37 
 
 
407 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.34 
 
 
403 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  36.2 
 
 
412 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  38.34 
 
 
400 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.34 
 
 
400 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.8 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.46 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  36.73 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.73 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  36.87 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.78 
 
 
451 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.31 
 
 
405 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  33.41 
 
 
418 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.22 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.48 
 
 
409 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  35.55 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  35.61 
 
 
404 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.78 
 
 
412 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.78 
 
 
399 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.13 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.13 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.13 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.13 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.87 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.87 
 
 
451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.68 
 
 
405 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  34.49 
 
 
420 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33 
 
 
433 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.98 
 
 
430 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.22 
 
 
403 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.27 
 
 
412 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  33.25 
 
 
405 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
404 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
400 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.53 
 
 
393 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.13 
 
 
402 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32 
 
 
412 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32 
 
 
412 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
404 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
404 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 
404 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
400 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32.74 
 
 
405 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.98 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.82 
 
 
401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  31.57 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.87 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  33.06 
 
 
406 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
412 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.06 
 
 
393 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>