More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1779 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
430 aa  863    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.7 
 
 
411 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  61.54 
 
 
416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  60.85 
 
 
417 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  55.22 
 
 
424 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  55.05 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.72 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  56.47 
 
 
413 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  52.03 
 
 
413 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  56.47 
 
 
411 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.87 
 
 
412 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  56.22 
 
 
411 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.09 
 
 
413 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.98 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  53.12 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.12 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
412 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  54.32 
 
 
440 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
412 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
412 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
412 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 
412 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.48 
 
 
412 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  56.15 
 
 
412 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.92 
 
 
420 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  49.62 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  47.72 
 
 
414 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.48 
 
 
410 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.62 
 
 
416 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.14 
 
 
403 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
414 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  51.23 
 
 
420 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.76 
 
 
399 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.61 
 
 
407 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.12 
 
 
417 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.53 
 
 
412 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  52.51 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.19 
 
 
415 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  52.1 
 
 
411 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  52.1 
 
 
411 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.42 
 
 
418 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  50.12 
 
 
406 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.66 
 
 
429 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  46.29 
 
 
422 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.9 
 
 
393 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  51.76 
 
 
405 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.37 
 
 
413 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.51 
 
 
402 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 
393 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  49.61 
 
 
401 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 
393 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.13 
 
 
401 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.98 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.36 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  48.85 
 
 
405 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.76 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  46.27 
 
 
420 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.17 
 
 
434 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.63 
 
 
393 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.75 
 
 
418 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.85 
 
 
433 aa  323  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.84 
 
 
425 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.05 
 
 
404 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.62 
 
 
405 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.41 
 
 
419 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.78 
 
 
404 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.78 
 
 
400 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.51 
 
 
404 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.16 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.51 
 
 
400 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.51 
 
 
404 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.98 
 
 
413 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.8 
 
 
403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  46.27 
 
 
419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.4 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  46.85 
 
 
326 aa  299  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.23 
 
 
392 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.48 
 
 
412 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.25 
 
 
410 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  40.2 
 
 
395 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.73 
 
 
395 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.82 
 
 
413 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  43.11 
 
 
398 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.11 
 
 
398 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.61 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.99 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  40.55 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.17 
 
 
415 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.19 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.19 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.19 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.4 
 
 
409 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
451 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.59 
 
 
409 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  35.95 
 
 
438 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.41 
 
 
438 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>