More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5155 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
422 aa  858    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  70.34 
 
 
417 aa  567  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  58.7 
 
 
415 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.96 
 
 
429 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.52 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.27 
 
 
412 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.27 
 
 
412 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.5 
 
 
412 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.27 
 
 
412 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.27 
 
 
412 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.52 
 
 
412 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  58.25 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.37 
 
 
412 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  54.88 
 
 
412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.82 
 
 
416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  54.88 
 
 
412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  56.79 
 
 
411 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.3 
 
 
425 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  59.5 
 
 
419 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  56.79 
 
 
411 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.71 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59 
 
 
419 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.01 
 
 
413 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.84 
 
 
418 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  58.75 
 
 
419 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.98 
 
 
415 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  52.15 
 
 
414 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.15 
 
 
410 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  57.94 
 
 
412 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.39 
 
 
413 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  62.27 
 
 
326 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.87 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  48.76 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.48 
 
 
440 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.02 
 
 
401 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.65 
 
 
399 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  49.75 
 
 
401 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  51.16 
 
 
397 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  49.87 
 
 
405 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.65 
 
 
393 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  49.87 
 
 
405 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  48.49 
 
 
406 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.35 
 
 
393 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.48 
 
 
393 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.57 
 
 
434 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.19 
 
 
424 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  50.5 
 
 
440 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.62 
 
 
413 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  49.37 
 
 
413 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.37 
 
 
413 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.37 
 
 
413 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  48.02 
 
 
420 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  47 
 
 
411 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.7 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.88 
 
 
417 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  45.61 
 
 
411 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.2 
 
 
402 aa  352  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  47.51 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.31 
 
 
413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.37 
 
 
405 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.68 
 
 
430 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
404 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
400 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
404 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
404 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
400 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  46.34 
 
 
405 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.41 
 
 
404 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.06 
 
 
412 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.71 
 
 
425 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.22 
 
 
433 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.53 
 
 
411 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.74 
 
 
392 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.04 
 
 
403 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.78 
 
 
425 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.21 
 
 
412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.33 
 
 
395 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.71 
 
 
420 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.3 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.4 
 
 
395 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.66 
 
 
413 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.92 
 
 
418 aa  245  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 
410 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.28 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.28 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.44 
 
 
398 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  38.54 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.62 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.15 
 
 
411 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.15 
 
 
411 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.15 
 
 
411 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.45 
 
 
409 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.3 
 
 
400 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.47 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.41 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.02 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.7 
 
 
390 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.92 
 
 
448 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.5 
 
 
403 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>