More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2163 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  81.27 
 
 		 395 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 395 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  78.83 
 
 		 395 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  81.52 
 
 		 395 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  78.85 
 
 		 395 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  76.46 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  73.92 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  73.67 
 
 		 394 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  68.1 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  66.06 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  61.27 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.98 
 
 		 409 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.06 
 
 		 400 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  43.32 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.96 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.48 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.48 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  45.22 
 
 		 423 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.93 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.74 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  44.74 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.74 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.63 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.28 
 
 		 403 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.23 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.67 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  45.74 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.35 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  44.59 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  44.59 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  44.59 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  46.36 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  37.66 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.34 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.08 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.08 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  35.42 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.94 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.28 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.69 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  38.07 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.79 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.91 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.46 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.75 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  32.56 
 
 		 420 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  32.16 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.16 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.57 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.99 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.83 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.7 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.41 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.43 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  33.42 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.99 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.91 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  32.47 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  30.91 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.91 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.07 
 
 		 413 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  32 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.41 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.65 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.82 
 
 		 433 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.03 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.72 
 
 		 412 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.43 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.35 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.36 
 
 		 392 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.21 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  29.15 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30.83 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.33 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  33.76 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.47 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.97 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.08 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.53 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.43 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.35 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.85 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.25 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.11 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.91 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  32.3 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  32.3 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.55 
 
 		 429 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.09 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  30.91 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  30.47 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.55 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.865313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>