More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0761 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
390 aa  785    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  96.67 
 
 
390 aa  745    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  59.01 
 
 
400 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  59.74 
 
 
400 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.21 
 
 
391 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.21 
 
 
391 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  60.95 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  60.16 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  60.16 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  60.16 
 
 
384 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  60.95 
 
 
423 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.52 
 
 
403 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  57.52 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.52 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.11 
 
 
403 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.34 
 
 
403 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.06 
 
 
403 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  57.52 
 
 
403 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  53.3 
 
 
383 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  48.54 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.7 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  48.28 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.35 
 
 
395 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  47.81 
 
 
395 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.42 
 
 
395 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  46.15 
 
 
395 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.86 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.89 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.97 
 
 
395 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.39 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  42.4 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.64 
 
 
401 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.62 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.89 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.89 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  36.51 
 
 
417 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  39.74 
 
 
402 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.66 
 
 
400 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.62 
 
 
402 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.64 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.77 
 
 
412 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  36.77 
 
 
412 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.77 
 
 
412 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  37.36 
 
 
392 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.77 
 
 
412 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.77 
 
 
412 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.77 
 
 
412 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.77 
 
 
412 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
451 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.09 
 
 
375 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
412 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40 
 
 
395 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  37.4 
 
 
420 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.37 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.87 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  36.75 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  37.37 
 
 
412 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.96 
 
 
440 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  36.34 
 
 
405 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  35.81 
 
 
425 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  36.29 
 
 
414 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.03 
 
 
403 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  36.22 
 
 
424 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.46 
 
 
410 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.81 
 
 
399 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.23 
 
 
405 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.22 
 
 
433 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.7 
 
 
413 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.38 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  34.6 
 
 
440 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.91 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  36.17 
 
 
413 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  36.07 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.98 
 
 
417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.64 
 
 
413 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.81 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  35.54 
 
 
401 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 
407 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.56 
 
 
415 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  33.07 
 
 
422 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.01 
 
 
392 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.67 
 
 
405 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.13 
 
 
434 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  34.89 
 
 
364 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.98 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.13 
 
 
413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  35.05 
 
 
411 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.29 
 
 
397 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.36 
 
 
425 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.87 
 
 
425 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  34.51 
 
 
411 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.7 
 
 
402 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.28 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.93 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  34.93 
 
 
406 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.95 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  34.87 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.22 
 
 
393 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  34.22 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>