More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3463 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 
400 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  50.67 
 
 
396 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.67 
 
 
396 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.67 
 
 
396 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  45.04 
 
 
417 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.56 
 
 
402 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.07 
 
 
402 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.37 
 
 
401 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.13 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.84 
 
 
404 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.99 
 
 
375 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.72 
 
 
395 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.27 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  38.01 
 
 
392 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  37.56 
 
 
394 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  37.56 
 
 
394 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.44 
 
 
395 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  38.4 
 
 
403 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.4 
 
 
403 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.13 
 
 
403 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.71 
 
 
390 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  35.51 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.51 
 
 
395 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.25 
 
 
395 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  39.53 
 
 
364 aa  222  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.6 
 
 
403 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.44 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  38.5 
 
 
423 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  35.16 
 
 
395 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 
391 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.43 
 
 
403 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.24 
 
 
391 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.48 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.64 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.6 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  38.5 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.6 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  34.19 
 
 
400 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  33.33 
 
 
394 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  36.1 
 
 
383 aa  205  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  37.17 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  37.17 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  37.17 
 
 
384 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.62 
 
 
424 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  34.92 
 
 
420 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.43 
 
 
416 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.18 
 
 
393 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
422 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.56 
 
 
413 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
403 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  33.83 
 
 
406 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.76 
 
 
412 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  33.25 
 
 
401 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.92 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.69 
 
 
451 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.51 
 
 
412 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 
412 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  31.36 
 
 
425 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.69 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 
412 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 
412 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 
412 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.84 
 
 
399 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.42 
 
 
412 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.85 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.5 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.06 
 
 
402 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
410 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.18 
 
 
440 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  33.76 
 
 
405 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  32.99 
 
 
414 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  34.55 
 
 
411 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.62 
 
 
417 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.48 
 
 
415 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.74 
 
 
433 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  34.03 
 
 
411 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  33.77 
 
 
405 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  32.7 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.68 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.52 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.82 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.08 
 
 
413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  32.56 
 
 
413 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.12 
 
 
410 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.05 
 
 
429 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.56 
 
 
413 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  30.93 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.1 
 
 
425 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.95 
 
 
413 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  32.23 
 
 
414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.98 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  32.71 
 
 
412 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.87 
 
 
426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  31.3 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.82 
 
 
430 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  31.3 
 
 
411 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
434 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>