More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0983 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
375 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.56 
 
 
400 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.85 
 
 
409 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.7 
 
 
404 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.5 
 
 
401 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  39.29 
 
 
417 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.69 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.6 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.6 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.6 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.02 
 
 
391 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.02 
 
 
391 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  39.69 
 
 
402 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.18 
 
 
402 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  40.75 
 
 
423 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  41.1 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  41.8 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  41.8 
 
 
384 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  41.8 
 
 
416 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.94 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.7 
 
 
395 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  39.95 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.68 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.14 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 
403 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  36.6 
 
 
392 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.81 
 
 
403 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  36.51 
 
 
400 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.5 
 
 
390 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.84 
 
 
393 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  35.77 
 
 
395 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.04 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.3 
 
 
403 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.35 
 
 
403 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.77 
 
 
403 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.78 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.36 
 
 
448 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  36.75 
 
 
394 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  36.75 
 
 
394 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  34.47 
 
 
394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.791276 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03239  thermophilic desulfurizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01010)  37.19 
 
 
364 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.657746  normal  0.586431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.92 
 
 
413 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  34.82 
 
 
383 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.6 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.19 
 
 
415 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  32.9 
 
 
420 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.69 
 
 
417 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.51 
 
 
401 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.97 
 
 
412 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.95 
 
 
397 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.95 
 
 
393 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  31.25 
 
 
406 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  30.26 
 
 
401 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.25 
 
 
393 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.93 
 
 
395 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.37 
 
 
407 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.49 
 
 
399 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.87 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.38 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.38 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.85 
 
 
433 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.11 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.92 
 
 
413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.11 
 
 
413 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  30.49 
 
 
422 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.82 
 
 
402 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.48 
 
 
405 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.67 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  29.97 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.59 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  34.88 
 
 
326 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.74 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  33.07 
 
 
414 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
400 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
404 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.51 
 
 
405 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.68 
 
 
392 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 
404 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.9 
 
 
413 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  32.61 
 
 
412 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.39 
 
 
410 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  31.77 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  31.56 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.38 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.05 
 
 
405 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 
405 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  32.53 
 
 
405 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.8 
 
 
418 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>