More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4934 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 403 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  89.08 
 
 		 403 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3396  acyl-CoA dehydrogenase type 2  87.59 
 
 		 403 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0314  Acyl-CoA dehydrogenase-like  92.56 
 
 		 403 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  99.26 
 
 		 403 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  88.34 
 
 		 403 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  99.26 
 
 		 403 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  80.15 
 
 		 423 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  83.42 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  83.16 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  80.15 
 
 		 423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  78.91 
 
 		 416 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  81.84 
 
 		 384 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  81.84 
 
 		 384 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4541  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  69.98 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0855  putative monooxygenase  69.55 
 
 		 400 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110147  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  58.2 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0761  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  58.47 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0958645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.65 
 
 		 409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44510  Acyl-CoA dehydrogenase/oxydase  53.19 
 
 		 383 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.74 
 
 		 395 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43890  Acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.41 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2981  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.07 
 
 		 395 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2772  monooxygenase, putative  42.82 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0557  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.67 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.5 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2907  putative FMNH2-dependent monooxygenase  45.14 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34200  putative FMNH2-dependent monooxygenase  45.14 
 
 		 394 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.911533  normal  0.0321853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3917  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.63 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1247  putative monooxygenase  40.71 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.791276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1773  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.75 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0063  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.69 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0894  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.16 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0403335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0888  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.43 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.43 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1496  FMNH2-dependent monooxygenase  38.44 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1128  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.36 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3463  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  38.13 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  40.11 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0983  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.93 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6564  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.54 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.82838  normal  0.227478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.37 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6149  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.64 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176892  hitchhiker  0.003301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  36.72 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.03 
 
 		 451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.03 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.76 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.76 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.76 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.76 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  34.59 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.59 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.34 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  37.13 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.14 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  37.13 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  33.24 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.92 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.98 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  36.06 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.57 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  35.85 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  35.85 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.69 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  35.58 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  36.92 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.87 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  36.92 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.32 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  31.5 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.42 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.07 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.5 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.43 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.37 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  33.58 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  35.11 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.95 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.75 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.98 
 
 		 440 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.23 
 
 		 413 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.83 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.45 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.34 
 
 		 425 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.32 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.92 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.23 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.78 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.85 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.69 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  33.42 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.51 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.19 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.22 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.34 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.01 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.79 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.67 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.92 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.88 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>