More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0137 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  88.64 
 
 
405 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  73.54 
 
 
405 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  73.79 
 
 
405 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  73.79 
 
 
405 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  73.03 
 
 
405 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.75 
 
 
407 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  47.88 
 
 
412 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.99 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.8 
 
 
412 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.8 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.77 
 
 
415 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  40.73 
 
 
412 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.55 
 
 
409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.27 
 
 
406 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.69 
 
 
420 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.74 
 
 
437 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  38.56 
 
 
412 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  39.74 
 
 
419 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  37.33 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  39.21 
 
 
419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  37.93 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.67 
 
 
416 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.66 
 
 
416 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.62 
 
 
407 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.69 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  36.69 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.69 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.68 
 
 
436 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.63 
 
 
407 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.08 
 
 
413 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 
403 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.58 
 
 
451 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.5 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.69 
 
 
425 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.07 
 
 
413 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
451 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.07 
 
 
412 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.06 
 
 
412 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  32.7 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
412 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.25 
 
 
412 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
412 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.43 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  34.83 
 
 
412 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  36.34 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.64 
 
 
419 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.7 
 
 
415 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.75 
 
 
407 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.39 
 
 
426 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.31 
 
 
407 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  37.43 
 
 
423 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.43 
 
 
423 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.31 
 
 
407 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.3 
 
 
417 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.3 
 
 
420 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.98 
 
 
405 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 
438 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  36.19 
 
 
438 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  34.22 
 
 
434 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 
438 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
438 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
438 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.9 
 
 
408 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.81 
 
 
405 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.15 
 
 
422 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.81 
 
 
415 aa  186  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  34.38 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.38 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.42 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.76 
 
 
413 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.81 
 
 
407 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.86 
 
 
393 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.6 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.58 
 
 
424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.58 
 
 
416 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.88 
 
 
407 aa  177  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.2 
 
 
429 aa  176  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.86 
 
 
440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.76 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.59 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 
413 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.86 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  30.56 
 
 
413 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  30.75 
 
 
440 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  32.71 
 
 
414 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.47 
 
 
434 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 
413 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  32.19 
 
 
405 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 
413 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>