More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1517 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1517  Acyl-CoA dehydrogenases  100 
 
 
419 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0186344  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1171  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  99.28 
 
 
419 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0026  acyl-CoA dehydrogenase-family protein  99.52 
 
 
419 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1379  acyl-CoA dehydrogenase family protein  90.45 
 
 
419 aa  727    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461984  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1431  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.28 
 
 
419 aa  825    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453095  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0410  DszC family monooxygenase  99.28 
 
 
419 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.993874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0129  acyl-CoA dehydrogenase  99.28 
 
 
419 aa  825    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  76.1 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282108  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0553  acyl-CoA dehydrogenase type 2  68.93 
 
 
413 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43640  Acyl-CoA dehydrogenase  70.18 
 
 
412 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.21996  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6339  acyl-CoA dehydrogenase type 2  73.77 
 
 
415 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6516  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  73.58 
 
 
423 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6750  acyl-CoA dehydrogenase type 2  73.58 
 
 
423 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.12749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2762  hypothetical protein  64.34 
 
 
412 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2873  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  64.88 
 
 
412 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2991  acyl-CoA dehydrogenase type 2  64.09 
 
 
412 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  69.5 
 
 
419 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  68.5 
 
 
419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  63.9 
 
 
412 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1121  acyl-CoA dehydrogenase type 2  62.84 
 
 
413 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7162  thermophilic desulfurizing enzyme  55.1 
 
 
408 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3804  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  55.61 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0722359  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3496  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.61 
 
 
437 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3878  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  55.19 
 
 
416 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  54.55 
 
 
407 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4855  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.44 
 
 
408 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.65 
 
 
407 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.76 
 
 
416 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5871  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.54 
 
 
407 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.211038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3661  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.94 
 
 
407 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454274  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3336  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.17 
 
 
407 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1593  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.79 
 
 
407 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.513495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2524  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.12 
 
 
417 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1136  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  52.32 
 
 
422 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1907  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.25 
 
 
406 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740935  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1775  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.67 
 
 
436 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3354  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  47.42 
 
 
415 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1793  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  48.63 
 
 
420 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.298522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.68 
 
 
403 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1358  hypothetical protein  41.25 
 
 
434 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992963  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5260  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  41.25 
 
 
426 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.997637  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2443  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.52 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1175  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.26 
 
 
438 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1248  Acyl-CoA dehydrogenases  43.26 
 
 
438 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 
438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3296  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.11 
 
 
409 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43800  hypothetical protein  42.93 
 
 
412 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3947  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.27 
 
 
403 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0180672 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5663  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.68 
 
 
407 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3932  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  42.01 
 
 
400 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.01 
 
 
400 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
412 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  35.07 
 
 
412 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02440  acyl-CoA dehydrogenase  37.38 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.34 
 
 
416 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.44 
 
 
405 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  40.32 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.32 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  39.35 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0984  hypothetical protein  37.02 
 
 
408 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3467  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.56 
 
 
409 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1567  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.29 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0137  hypothetical protein  35.92 
 
 
405 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2635  putative Acyl-CoA dehydrogenase  36.83 
 
 
404 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578024  hitchhiker  0.0000107423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.97 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 
412 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.23 
 
 
412 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  33.59 
 
 
412 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 
412 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
412 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
412 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.68 
 
 
451 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.88 
 
 
413 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  36.41 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.77 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.7 
 
 
433 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  32.92 
 
 
425 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.02 
 
 
400 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  34.4 
 
 
412 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  33.17 
 
 
420 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.02 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.02 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  35.23 
 
 
406 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.23 
 
 
393 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.51 
 
 
393 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.13 
 
 
405 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.13 
 
 
405 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.81 
 
 
395 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.48 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.48 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.48 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.82 
 
 
415 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.5 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.1 
 
 
401 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>