More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2361 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 412 aa  819    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  69.55 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  66 
 
 		 413 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  68.41 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  68.41 
 
 		 440 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.59 
 
 		 413 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  69.23 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  68.98 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  67.4 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  65.53 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  64.81 
 
 		 411 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  59.44 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.92 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  53.43 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.43 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.1 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.59 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  57.22 
 
 		 417 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  58.04 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.76 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  50.49 
 
 		 425 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  55.75 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  50.38 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.65 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.27 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  53.47 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  52.96 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.51 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.16 
 
 		 430 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  48.42 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.32 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  49.74 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  51.14 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  46.31 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  46.87 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.57 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.23 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  50.26 
 
 		 401 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.57 
 
 		 417 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.26 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.13 
 
 		 393 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  50 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.5 
 
 		 402 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  51.4 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  51.4 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.52 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.38 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.24 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  51.6 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.83 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  50.26 
 
 		 419 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.26 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.6 
 
 		 418 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  49.62 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  49.69 
 
 		 326 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.45 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.88 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.03 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.03 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.86 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.03 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.76 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.76 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.76 
 
 		 400 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 		 393 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.18 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.3 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.79 
 
 		 405 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.74 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.93 
 
 		 413 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.06 
 
 		 425 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.96 
 
 		 425 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.93 
 
 		 413 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.86 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.87 
 
 		 412 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.94 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.15 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.1 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.6 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.6 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  41.15 
 
 		 403 aa  232  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.86 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.08 
 
 		 451 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.9 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.9 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.9 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.5 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  31.22 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0695  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.3 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801723  normal  0.240956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34580  hypothetical protein  33.6 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797215  normal  0.181748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2935  hypothetical protein  33.69 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2163  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.96 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893753  normal  0.219871 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.73 
 
 		 448 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>