147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0520 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  100 
 
 		 534 aa  1067    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  37.47 
 
 		 405 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  35.32 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.96 
 
 		 400 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  34.71 
 
 		 397 aa  243  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  32.85 
 
 		 421 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  32.12 
 
 		 402 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  33.81 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  30.73 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  30.35 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  30.5 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  32.94 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  30.5 
 
 		 392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  30.34 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  29.66 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  30.39 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  29.04 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  30.88 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  30.73 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  32.35 
 
 		 393 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  28.31 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  28.31 
 
 		 396 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  29.72 
 
 		 404 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  31.49 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  31.81 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  31.67 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  30.21 
 
 		 405 aa  161  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  30.28 
 
 		 374 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  30.07 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  40.65 
 
 		 382 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.41 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  29.61 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  30.14 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  38.31 
 
 		 410 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.82 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  38.93 
 
 		 409 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  38.52 
 
 		 410 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  38.52 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.11 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  38.11 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  38.11 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  37.9 
 
 		 410 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  41.55 
 
 		 380 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  30.11 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.11 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  40 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  37.14 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  37.76 
 
 		 376 aa  144  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  38.59 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  29 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  29.41 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  29 
 
 		 380 aa  141  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  31.52 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  29.55 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  29.06 
 
 		 542 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  26.79 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  29.37 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  27.84 
 
 		 414 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.59 
 
 		 506 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  27.29 
 
 		 422 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  28.64 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  29.59 
 
 		 362 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  29.59 
 
 		 369 aa  130  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  30.7 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.8 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  30.23 
 
 		 497 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  27.29 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  27.39 
 
 		 431 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  28.67 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  56.76 
 
 		 134 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  31.23 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  28.06 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.8 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  28.33 
 
 		 514 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  35.1 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5039  MltA domain-containing protein  29.83 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  27.82 
 
 		 382 aa  120  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.11 
 
 		 399 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  35.57 
 
 		 382 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  28.86 
 
 		 365 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  28.77 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  29.27 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  34.3 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  28.74 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  34.67 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  29.13 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  27.91 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  34.3 
 
 		 341 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  28.06 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  26.48 
 
 		 372 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  27.99 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  32.08 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  26.92 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  30.72 
 
 		 384 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.38 
 
 		 381 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>