146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0936 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
372 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
382 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  85.12 
 
 
410 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  96 
 
 
433 aa  795    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  85.12 
 
 
409 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  84.39 
 
 
410 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  85.85 
 
 
410 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  85.61 
 
 
410 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
425 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  80.73 
 
 
410 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  85.61 
 
 
410 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  84.76 
 
 
374 aa  627  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  79.41 
 
 
374 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  79.41 
 
 
374 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0640  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  57.57 
 
 
382 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  55.25 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  60.68 
 
 
380 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  59.88 
 
 
384 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  59.26 
 
 
380 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  54.91 
 
 
374 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  46.3 
 
 
375 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  50.62 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  49.29 
 
 
405 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  48.27 
 
 
397 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  50.88 
 
 
418 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  48.29 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  45.61 
 
 
421 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 
134 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.61 
 
 
397 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  40.62 
 
 
431 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  43.21 
 
 
352 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  43.87 
 
 
456 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  44.48 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  42.11 
 
 
416 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  44.48 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  44.44 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  41.54 
 
 
398 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  38.37 
 
 
386 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.58 
 
 
386 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  37.28 
 
 
392 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  37.28 
 
 
392 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  37.4 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  38.53 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.81 
 
 
342 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.27 
 
 
385 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  43.79 
 
 
341 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  41.61 
 
 
338 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  44.41 
 
 
341 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  39.77 
 
 
386 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  39.73 
 
 
475 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  38.48 
 
 
399 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  41.21 
 
 
435 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  37.23 
 
 
402 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  40.87 
 
 
414 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  39.84 
 
 
382 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  40.7 
 
 
422 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  39 
 
 
403 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  33.61 
 
 
398 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  40.12 
 
 
341 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.88 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  32.87 
 
 
542 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.68 
 
 
543 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  39.68 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 
502 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  35.48 
 
 
500 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 
506 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  38.29 
 
 
354 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  36.12 
 
 
492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  42.81 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  38.66 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  35.26 
 
 
356 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  34.25 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  34.25 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  32.54 
 
 
497 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  38.1 
 
 
416 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  35.6 
 
 
413 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  38.26 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  34.58 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  40.77 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  35.54 
 
 
368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  39.8 
 
 
395 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  36.8 
 
 
386 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  34.38 
 
 
407 aa  170  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  38.41 
 
 
351 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  39.93 
 
 
405 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  36.86 
 
 
514 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  39.1 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  39.1 
 
 
389 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  31.86 
 
 
400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.94 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  38.28 
 
 
363 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  37.08 
 
 
390 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  38.83 
 
 
412 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  32.59 
 
 
365 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>