147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4828 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  868    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  73.7 
 
 
402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  71.36 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  73.23 
 
 
380 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  66.83 
 
 
416 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  61.48 
 
 
456 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  64.81 
 
 
422 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  59.42 
 
 
382 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  63.66 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  49.65 
 
 
431 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  53.43 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  42.9 
 
 
410 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  38.82 
 
 
375 aa  242  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.67 
 
 
374 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  42.62 
 
 
410 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  41.12 
 
 
410 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  41.4 
 
 
374 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  42.62 
 
 
374 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  41.33 
 
 
382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  41.77 
 
 
376 aa  235  9e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  41.78 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  41.5 
 
 
409 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  40.96 
 
 
393 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.71 
 
 
410 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  42.06 
 
 
410 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.86 
 
 
400 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
425 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
425 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
425 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
425 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.21 
 
 
372 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  40.92 
 
 
433 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  42.02 
 
 
374 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  38.05 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  38.86 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  41.67 
 
 
418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  39.17 
 
 
380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  39.47 
 
 
384 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  39.76 
 
 
380 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  38.42 
 
 
399 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  36.24 
 
 
397 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  34.86 
 
 
392 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.01 
 
 
543 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  38.14 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  35.29 
 
 
383 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  34.38 
 
 
392 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.74 
 
 
385 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  38.84 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.46 
 
 
386 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  34.03 
 
 
500 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  28.47 
 
 
386 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  36.03 
 
 
398 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.24 
 
 
502 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  33.96 
 
 
542 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  35.87 
 
 
396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  36.06 
 
 
402 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.2 
 
 
342 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.77 
 
 
352 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  35.01 
 
 
421 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  38.56 
 
 
341 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  45.85 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  37.01 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  45.85 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  28.79 
 
 
356 aa  172  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  34.58 
 
 
382 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  35.5 
 
 
475 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.22 
 
 
506 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  33.15 
 
 
368 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  39.22 
 
 
405 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  37.01 
 
 
369 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  35.83 
 
 
338 aa  166  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  37.54 
 
 
413 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  38.44 
 
 
351 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  38.51 
 
 
398 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  34.73 
 
 
416 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  35.29 
 
 
365 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 
381 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  33.98 
 
 
514 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  32.35 
 
 
492 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  32.18 
 
 
497 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  36 
 
 
372 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  34.51 
 
 
418 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  34.51 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  36.14 
 
 
372 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  38.63 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  39.78 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  28.31 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  27.78 
 
 
396 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  36.92 
 
 
381 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  37.38 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  32.58 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  33.92 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  40 
 
 
407 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  32.43 
 
 
383 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  36.22 
 
 
404 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  37.14 
 
 
405 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.87 
 
 
399 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  34.32 
 
 
386 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  35.4 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>