146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4013 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  100 
 
 		 402 aa  800    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  100 
 
 		 380 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  76.92 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  74.19 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  69.7 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  63.05 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  63.03 
 
 		 382 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  68.36 
 
 		 422 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  65.48 
 
 		 414 aa  464  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  51.18 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  55.79 
 
 		 397 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  44.66 
 
 		 374 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.82 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  44.69 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  39.37 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  43.72 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  43.36 
 
 		 382 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  43.29 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  45.24 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  44.1 
 
 		 410 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  44.67 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  44.96 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  43.79 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 372 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  44.07 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  45.24 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  39.27 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  43.34 
 
 		 433 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  42.35 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  41.8 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  42.35 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.71 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  44.48 
 
 		 374 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  37.46 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  39.66 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  37.97 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.57 
 
 		 392 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.47 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  30 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.29 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  36.63 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  37.46 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.57 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  37.68 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  37.5 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  37.93 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  36.21 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.01 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.71 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  37.37 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  41.3 
 
 		 341 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  43.89 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.52 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  33.43 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  33.6 
 
 		 542 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 502 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  34.16 
 
 		 362 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  33.68 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  46 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  46 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  33.88 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  36.42 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  38.18 
 
 		 398 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  35.58 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  40.73 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  34.7 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  30.56 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.81 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  34.23 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.8 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  34.23 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  38.12 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  35.53 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  33.54 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  35.08 
 
 		 416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  32.47 
 
 		 492 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  28.34 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  28.07 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  38.35 
 
 		 381 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  31.15 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  33.03 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  38.3 
 
 		 514 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  41.09 
 
 		 407 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  32.49 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  32.05 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  33.99 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  34.38 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  32.63 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  37.91 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  39.43 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  33.83 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  34.97 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  34.97 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  58.78 
 
 		 134 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  35.46 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>