147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3173 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3173  MltA  100 
 
 		 382 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  83.55 
 
 		 393 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  67.04 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  67.15 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  67.15 
 
 		 380 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  55.22 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  56.72 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  57.14 
 
 		 374 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  62.2 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  60.37 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  59.76 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  60.37 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  60.67 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  60.67 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  62.42 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  60.67 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  60.67 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  60.98 
 
 		 410 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  54.32 
 
 		 375 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  54.44 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  49.59 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  50.58 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  51.02 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  50.15 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  46.88 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  49.7 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  44.07 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  45.21 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  40.05 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  38.29 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  42.99 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  45.92 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  45.21 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  39.52 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  40.11 
 
 		 385 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  41.92 
 
 		 386 aa  248  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  44.97 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  40 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  40.17 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  38.98 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  39.25 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  45.2 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  43.6 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  43.07 
 
 		 456 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  45.12 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  44.82 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  41 
 
 		 475 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  37.7 
 
 		 542 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  42.99 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  40.58 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  41.53 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  39.74 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  40.48 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  41.08 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  38.67 
 
 		 500 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  39.29 
 
 		 403 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 543 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  33.25 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 502 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  34.54 
 
 		 398 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  34.26 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  38.03 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  40.95 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  37.64 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.77 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  42.77 
 
 		 440 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.07 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0640  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  52.78 
 
 		 277 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  37.57 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  36.04 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  34.55 
 
 		 362 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  34.34 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  39.31 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  70.15 
 
 		 134 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  36.26 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  38.01 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  36.29 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  34.36 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.42 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  37.12 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.97 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  32.87 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  38.89 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  35.38 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  35 
 
 		 514 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  35.54 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  35.54 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  35.76 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.59 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  32.59 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  35 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  36.68 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  40.07 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  37.87 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  33.06 
 
 		 365 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>